RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 RAB11FIP3O75154 756 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 CERS5Q8N5B7 392 aa26.79■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 EPHX2P34913 555 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 MICALL2Q8IY33 904 aa26.78■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC25A39-201ENST00000225308 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBTB22O15209 634 aa26.76■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
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SLC25A39-201ENST00000225308 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 AACSQ86V21 672 aa26.75■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 POTEIP0CG38 1075 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 POTEJP0CG39 1038 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 RASGRF1Q13972 1273 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 GORABQ5T7V8 394 aa26.74■■□□□ 1.87
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SLC25A39-201ENST00000225308 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 SEMA3EO15041 775 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L8P0C7I0 530 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.73■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 H7C1D1 291 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 EGFRP00533 1210 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.72■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC25A39-201ENST00000225308 TOMM70O94826 608 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 SCARF1Q14162 830 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 GRIK5Q16478 980 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 PI16Q6UXB8 463 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 OGFOD1Q8N543 542 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 BCL11AQ9H165 835 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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SLC25A39-201ENST00000225308 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 F8W031 263 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 IGHDP01880 384 aa26.68■■□□□ 1.86
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SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 GCC1Q96CN9 775 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.67■■□□□ 1.86
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SLC25A39-201ENST00000225308 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 LDHDQ86WU2 507 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 SPATA5Q8NB90 893 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 MMP14P50281 582 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.65■■□□□ 1.86
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SLC25A39-201ENST00000225308 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC25A39-201ENST00000225308 PRDX5P30044 214 aa26.64■■□□□ 1.85
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SLC25A39-201ENST00000225308 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 CHADLQ6NUI6 762 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 WNT10BO00744 389 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 NBPF9Q3BBW0 867 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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