RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	HCCS	P53701	268 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK11-1	P61568	191 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	MICA	Q29983	383 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB136	Q30KP8	78 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX38	Q6PEX7	206 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TOMM40L	Q969M1	308 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	RPE	Q96AT9	228 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	REEP1	Q9H902	201 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	FUOM	A2VDF0	154 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OOSP1	A8MZH6	123 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	MGST3	O14880	152 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF254	O75437	659 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	E2F6	O75461	281 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB5A	P00167	134 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP1	P28562	367 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RX3	P56373	397 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	HNF4G	Q14541	408 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CPO	Q8IVL8	374 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OR56B4	Q8NH76	319 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ING3	Q9NXR8	418 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	HHLA2	Q9UM44	414 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	8.51	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511		F8VVB4	439 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511		F8VWA3	439 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SIRPB1	O00241	398 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV1-47	P01700	117 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TTR	P02766	147 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NFYB	P25208	207 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PTGFR	P43088	359 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	GINS1	Q14691	196 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM42	Q69YG0	159 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	STPG2	Q8N412	459 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BORCS8	Q96FH0	119 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX12	Q9BXU0	123 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	GON7	Q9BXV9	100 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BSH0	61 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF16	O43320	207 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV3-1	P01715	115 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGN1	P05114	100 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CALCB	P10092	127 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B1	P14061	328 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKACA	P17612	351 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	POU3F4	P49335	361 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	FUT6	P51993	359 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTR3	P61158	418 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF91	Q05481	1191 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BNIP1	Q12981	228 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	APOF	Q13790	326 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR2DS1	Q14954	304 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ODF4	Q2M2E3	257 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZSN1	163 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8IYB0	196 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DRAM1	Q8N682	238 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ISOC1	Q96CN7	298 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		8.49	□□□□□ -1.05

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