RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ING3Q9NXR8 418 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SCN3BQ9NY72 215 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MEGF11A6BM72 1044 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 HSPB6O14558 160 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MGST3O14880 152 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 DEGS1O15121 323 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MAGEB3O15480 346 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 HTR3BO95264 441 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MAS1P04201 325 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 CFPP27918 469 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GDNFP39905 211 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 BDH1Q02338 343 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SPHARQ15513 63 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM86BQ8N661 226 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF714Q96N38 554 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 VCX3BQ9H321 246 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 RHOFQ9HBH0 211 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 GLS2Q9UI32 602 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ING4Q9UNL4 249 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TPRKBQ9Y3C4 175 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PPH5 198 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 hADV38S2A0JD32 116 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ODF3BA8MYP8 253 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 RGS10O43665 173 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SC5DO75845 299 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 FBP1P09467 338 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 IL13RA2Q14627 380 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 RSU1Q15404 277 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MED22Q15528 200 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 LRRTM1Q86UE6 522 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 BEND2Q8NDZ0 799 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 OR4D6Q8NGJ1 314 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 MUL1Q969V5 352 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 TMED9Q9BVK6 235 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 IL36GQ9NZH8 169 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 C1RLQ9NZP8 487 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 RAB26Q9ULW5 256 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 FOXJ3Q9UPW0 622 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.71□□□□□ -1.01
ATG4B-210ENST00000428861 ODAMA1E959 279 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 FAM172BPA6NC97 362 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 GPR137BO60478 399 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 RBP4P02753 201 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CSN2P05814 226 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 SERPINA2P20848 420 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MDKP21741 143 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 VHLP40337 213 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MIDNQ504T8 468 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 KRBOX4Q5JUW0 171 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 BRICD5Q6PL45 260 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CHST4Q8NCG5 386 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 PIFOQ8TCI5 191 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CORO2AQ92828 525 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM203Q969S6 136 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 METTL9Q9H1A3 318 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CKLFQ9UBR5 152 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.7□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.7□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 CLPXO76031 633 aa8.7□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 PAHP00439 452 aa8.7□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 ARG1P05089 322 aa8.7□□□□□ -1.02
ATG4B-210ENST00000428861 HSMCR30P0CW71 290 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms