RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333467.3

APOBEC3B-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3B, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3B-201ENST00000333467 SSX5O60225 188 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 DHRS3O75911 302 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 SFT2D2O95562 160 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 RLN2P04090 185 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 SOD3P08294 240 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 NAT2P11245 290 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 GNB3P16520 340 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF83P51522 516 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF84P51523 738 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 GABRA6Q16445 453 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 SSX8Q7RTT4 187 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 AAED1Q7RTV5 226 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 POM121Q96HA1 1249 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 PGAM5Q96HS1 289 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 GPER1Q99527 375 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 SLC25A15Q9Y619 301 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR2AT4A6NND4 320 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 SHISA9B4DS77 424 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 MPIG6BO95866 241 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 DANCRP0C864 163 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 PAX1P15863 534 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 VAMP1P23763 118 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 CPT2P23786 658 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 WDFY1Q8IWB7 410 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 SLC38A6Q8IZM9 456 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ST8SIA4Q92187 359 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 SPTSSAQ969W0 71 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 S100A13Q99584 98 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 GAL3ST1Q99999 423 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 CHST5Q9GZS9 411 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 H7C1Q1 480 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 M0R1B8 84 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 TAAR5O14804 337 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 AMY2BP19961 511 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 CDKN1AP38936 164 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 PTGFRP43088 359 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ATP1B3P54709 279 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ATP5J2P56134 94 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 CLDN17P56750 224 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 MICBQ29980 383 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR52W1Q6IF63 320 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 DRAM2Q6UX65 266 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMEM108Q6UXF1 575 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 FAM57BQ71RH2 274 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 SLC30A7Q8NEW0 376 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 SPSB1Q96BD6 273 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 CMBLQ96DG6 245 aa9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 C5orf51A6NDU8 294 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 MPTX1A8MV57 137 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 RER1O15258 196 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 FGF16O43320 207 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 DHHO43323 396 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 CSN2P05814 226 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 AKR1C4P17516 323 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 PRKACBP22694 351 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 CD40P25942 277 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 OR3A4PP47883 348 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 SLC6A9P48067 706 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 LUMP51884 338 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 TMEM50BP56557 158 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 TGFBR3Q03167 851 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 ARFRP1Q13795 201 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 KISS1Q15726 138 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 MARCH1Q8TCQ1 289 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 RNF141Q8WVD5 230 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 MARC2Q969Z3 335 aa9.47□□□□□ -0.89
APOBEC3B-201ENST00000333467 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms