RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 FZR1Q9UM11 496 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 BSNQ9UPA5 3926 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PRRG2O14669 202 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 HS3ST1O14792 307 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PGA5P0DJD9 388 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FABP6P51161 128 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 Q6P435 159 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 Q8IYB0 196 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NRIP2Q9BQI9 281 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 GLAP06280 429 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 GRPP07492 148 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF728P0DKX0 622 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SERPINF1P36955 418 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FGL1Q08830 312 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 IGSF11Q5DX21 431 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 Q6ZR03 302 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF680Q8NEM1 530 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 COQ8AQ8NI60 647 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RDH5Q92781 318 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TOMM40LQ969M1 308 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 A8MXE2 369 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 M0R233 179 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 DEGS1O15121 323 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C4BPBP20851 252 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 GCH1P30793 250 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 HTR2BP41595 481 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 GFRALQ6UXV0 394 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 MOB3AQ96BX8 217 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 M0R1B8 84 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 GLP1RP43220 463 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TMPRSS3P57727 454 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FXYD4P59646 89 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 GSG1LQ6UXU4 331 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TMUB2Q71RG4 321 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RAB18Q9NP72 206 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 COMMD9Q9P000 198 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A0G2JNJ9 132 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C5orf51A6NDU8 294 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 IFNA2P01563 188 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM87AP0C7U9 286 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF44P15621 663 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 BMP5P22003 454 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 AADACP22760 399 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 MUCL1Q96DR8 90 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 Q9UFV3 132 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TRDCB7Z8K6 153 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAP1O75689 374 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NXPH2O95156 264 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SCTP09683 121 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC25A4P12235 298 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RPA2P15927 270 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 S100A11P31949 105 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 UCP3P55916 312 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM27E3Q08E93 113 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 MSMPQ1L6U9 139 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM65Q6PI78 240 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 MSL2Q9HCI7 577 aa14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A1B0GWJ7 208 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PIGPP57054 158 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 POC1AQ8NBT0 407 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM210AQ96ND0 272 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NMES1Q9C002 83 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PIGMQ9H3S5 423 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 HES4Q9HCC6 221 aa14.6□□□□□ -0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms