RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC159	P0C7I6	412 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKACA	P17612	351 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	CD34	P28906	385 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	BRS3	P32247	399 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR3DL2	P43630	455 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	GLIPR1	P48060	266 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTR3	P61158	418 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	C12orf73	Q69YU5	71 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF329	Q86UD4	541 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA24	Q86W54	205 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338		Q8IYB0	196 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	RDH10	Q8IZV5	341 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	OSR2	Q8N2R0	312 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF649	Q9BS31	505 aa		9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	ZAR1L	A6NP61	321 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	LEUTX	A8MZ59	168 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	CLIC3	O95833	236 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2H2	O95918	312 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV1D-12	P01611	117 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	THBS3	P49746	956 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	RBP2	P50120	134 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	AES	Q08117	197 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	FLOT2	Q14254	428 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF596	Q8TC21	504 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	STMN2	Q93045	179 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	RFT1	Q96AA3	541 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	COQ2	Q96H96	371 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	HMG20A	Q9NP66	347 aa		9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	ODAM	A1E959	279 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMB11	A5LHX3	300 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL15	A6NJ78	407 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338		E9PQ18	207 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	OR3A4P	P47883	348 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	ISL1	P61371	349 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52W1	Q6IF63	320 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	GID4	Q8IVV7	300 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	CORO2A	Q92828	525 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	NRBF2	Q96F24	287 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	SPACA5	Q96QH8	159 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT84	Q9NSB2	600 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	ING3	Q9NXR8	418 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087X0M5	115 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GX30	115 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BUI4	141 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP8B1	O43520	1251 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGFR	P43088	359 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGDIB	P52566	201 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP1B3	P54709	279 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	MTCP1	P56278	107 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC42	P60953	191 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	TP53I3	Q53FA7	332 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	OR56B4	Q8NH76	319 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	PP6455	Q8WZ26	134 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	DPF1	Q92782	380 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		9.44	□□□□□ -0.9

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