RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 SEH1LQ96EE3 360 aa9.55□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q96M66 194 aa9.55□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR8B2Q96RD0 313 aa9.55□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 TM2D1Q9BX74 207 aa9.55□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 SELENOIQ9C0D9 397 aa9.55□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.55□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.55□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPATA2Q9UM82 520 aa9.55□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1W2PP11 408 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 A6NHS1 94 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 H7C1Q1 480 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 DEGS1O15121 323 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 ADAM20O43506 726 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV2-5P01817 119 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 INHBBP09529 407 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF44P15621 663 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 LMO1P25800 156 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 GABRA2P47869 451 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 KCNJ3P48549 501 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 IKZF1Q13422 519 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 PIGYQ3MUY2 71 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 MZT2AQ6P582 158 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 LGALS14Q8TCE9 139 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 CMTM3Q96MX0 182 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 GAFA1Q96PS6 74 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCL13Q99616 98 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 REG4Q9BYZ8 158 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 BARHL1Q9BZE3 327 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 BANF2Q9H503 90 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR5V1Q9UGF6 321 aa9.54□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A096LNT2 108 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 NDUFB3O43676 98 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF737O75373 536 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR2H2O95918 312 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 GLAP06280 429 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 WNT2P09544 360 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 GABRR1P24046 479 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 RBMXP38159 391 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 PITPNBP48739 271 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 RIPPLY3P57055 190 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 COL10A1Q03692 680 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 TAF9Q16594 264 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 ESCO2Q56NI9 601 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR10K2Q6IF99 312 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB12Q6IQ22 244 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6P435 159 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 CD177Q8N6Q3 437 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 COX4I2Q96KJ9 171 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 SNX22Q96L94 193 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 KCNK15Q9H427 330 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLN8Q9UBY8 286 aa9.53□□□□□ -0.88
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A075B6Q4 140 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A0A6YYH2 397 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A0B4J203 849 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 A6NJ64 397 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 A8MXK9 166 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 RNF223E7ERA6 249 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 K7N7A8 449 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 SIRPB1O00241 398 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 PDCD6O75340 191 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 FOXH1O75593 365 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 CSN2P05814 226 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 AMY2BP19961 511 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 FUT3P21217 361 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 DUSP1P28562 367 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 LMO4P61968 165 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 SCN1BQ07699 218 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 ARL6IP1Q15041 203 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q71RC1 249 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ARHGEF3-211ENST00000486829 BIVMQ86UB2 503 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms