RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.56■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 GDPD3Q7L5L3 318 aa16.56■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 LINC01006Q8NI28 216 aa16.56■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 FGGYQ96C11 551 aa16.56■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 CITED1Q99966 193 aa16.56■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 RNF114Q9Y508 228 aa16.56■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 MYL12BO14950 172 aa16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ANGPTL7O43827 346 aa16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 MAP2K4P45985 399 aa16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 SATL1Q86VE3 508 aa16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 SAXO1Q8IYX7 474 aa16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 PPP1R35Q8TAP8 253 aa16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 SLAMF9Q96A28 289 aa16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ALG8Q9BVK2 526 aa16.55■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 TMEM212A6NML5 194 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 F8VVB4 439 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 F8VWA3 439 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ZNF728P0DKX0 622 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ERP29P30040 261 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 DLX6P56179 175 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 PDZK1IP1Q13113 114 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 LIAT1Q6ZQX7 453 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 FAM58AQ8N1B3 248 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 OR4M1Q8NGD0 313 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 OR5D14Q8NGL3 314 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 OPALINQ96PE5 141 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ZNF649Q9BS31 505 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 RAB18Q9NP72 206 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ERVK13-1Q9NX77 482 aa16.54■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 hADV38S2A0JD32 116 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 H3BSH0 61 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 OCM2P0CE71 109 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 DLX1P56177 255 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 LGALS4P56470 323 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ZNF273Q14593 569 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 LHFPL3Q86UP9 236 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 SERPINA12Q8IW75 414 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 NANOGP1Q8N7R0 232 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 OR13F1Q8NGS4 319 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 OR13C3Q8NGS6 347 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 AJUBAQ96IF1 538 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 LINC00312Q9Y6C7 94 aa16.53■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 A0A1W2PRD5 423 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 A0A1W2PRF3 423 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 A0A1W2PRM7 423 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 VGLL3A8MV65 326 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 TIMM23O14925 209 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 HAND1O96004 215 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 PSMB9P28065 219 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ETV1P50549 477 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 PROK1P58294 105 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 CCDC58Q4VC31 144 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 C11orf88Q6PI97 169 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 Q6ZSV7 163 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 PNKDQ8N490 385 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 OR11H6Q8NGC7 330 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 SSX3Q99909 188 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 HMG20AQ9NP66 347 aa16.52■□□□□ 0.24
PITX3-201ENST00000370002 FUOMA2VDF0 154 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 MGST3O14880 152 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 KDM4BO94953 1096 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 INMTO95050 263 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 CCL3L1P16619 93 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 LMO1P25800 156 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 WNT4P56705 351 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 EDDM3BP56851 147 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 MED22Q15528 200 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 TREML4Q6UXN2 200 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 OR51A4Q8NGJ6 313 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 OR52N1Q8NH53 320 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 MALSU1Q96EH3 234 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 ZNF714Q96N38 554 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 FBLN5Q9UBX5 448 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 TMEM82A0PJX8 343 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 SH2D1BO14796 132 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 ZFPL1O95159 310 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 LIMS3P0CW19 117 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 LIMS4P0CW20 117 aa16.51■□□□□ 0.23
PITX3-201ENST00000370002 NPBWR2P48146 333 aa16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms