RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397317.8

CLDN7-202, Transcript of claudin 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN7, Length 1,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-202ENST00000397317 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.77□□□□□ -0.04
CLDN7-202ENST00000397317 MEGF11A6BM72 1044 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 FAM157CP0CG43 387 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SELLP14151 372 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 PRKACAP17612 351 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SRD5A1P18405 259 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 PTGFRP43088 359 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 MTNR1BP49286 362 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 CAPZA1P52907 286 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ZNF146Q15072 292 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 IL17RELQ6ZVW7 336 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 S100A13Q99584 98 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 OPN4Q9UHM6 478 aa14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ARL6IP5O75915 188 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 TNFAIP8O95379 198 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 HAND1O96004 215 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 MAS1P04201 325 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SFTPBP07988 381 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 UCHL1P09936 223 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 NDUFB7P17568 137 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 OR3A4PP47883 348 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 INSL4Q14641 139 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 RSU1Q15404 277 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ELP2Q6IA86 826 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ASCL4Q6XD76 172 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SLITRK2Q9H156 845 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.76□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SH2D1BO14796 132 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 AVPP01185 164 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 PSMB9P28065 219 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 FGF12P61328 243 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 COL10A1Q03692 680 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SCGB2A2Q13296 93 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 FGFRL1Q8N441 504 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 C8orf46Q8TAG6 207 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 NANPQ8TBE9 248 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 METTL9Q9H1A3 318 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 IL36GQ9NZH8 169 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 METRNQ9UJH8 293 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 K7N7A8 449 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 CCRL2O00421 344 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 TK1P04183 234 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 CALCBP10092 127 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SRMP19623 302 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SSX1Q16384 188 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 Q8NFD4 153 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SNX22Q96L94 193 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ING4Q9UNL4 249 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 JMJD1CQ15652 2540 aa14.74□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 ZNF737O75373 536 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 CSTBP04080 98 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 DUSP1P28562 367 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 FABP5Q01469 135 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 GPR176Q14439 515 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 CHST4Q8NCG5 386 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 MUL1Q969V5 352 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 UPRTQ96BW1 309 aa14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 A0A087WXM4 84 aa14.72□□□□□ -0.05
CLDN7-202ENST00000397317 A0A1W2PQ09 198 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms