RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362957.1

RNU6-1290P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1290, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1290P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RHBDL3P58872 404 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RAB4BP61018 213 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BIRC2Q13490 618 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RAB31Q13636 194 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 KCTD21Q4G0X4 260 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PATE2Q6UY27 113 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 C12orf54Q6X4T0 127 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DPPA2Q7Z7J5 298 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SERPINA12Q8IW75 414 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SFXN5Q8TD22 340 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TWIST2Q8WVJ9 160 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RSPH1Q8WYR4 309 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MYLPFQ96A32 169 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM230Q96A57 120 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TPD52L3Q96J77 140 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR5B12Q96R08 314 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HBEGFQ99075 208 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MGLLQ99685 303 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PRSS27Q9BQR3 290 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM213AQ9BRX8 229 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC39A3Q9BRY0 314 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SRRQ9GZT4 340 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CHST6Q9GZX3 395 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TSPYL1Q9H0U9 437 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TUFT1Q9NNX1 390 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 HOMER3Q9NSC5 361 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MED29Q9NX70 200 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TAC3Q9UHF0 121 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SPTBP11277 2137 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MCM3APO60318 1980 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RNF222A6NCQ9 220 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 K7EPK0 472 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GPR31O00270 319 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC17A3O00476 420 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CTNSO60931 367 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR2J3O76001 311 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CLPXO76031 633 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR7A10O76100 309 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DIRAS1O95057 198 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FGF1P05230 155 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 REG1AP05451 166 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GNA11P29992 359 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AKR1C2P52895 323 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 PPP5CP53041 499 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SSTP61278 116 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 AKR1C1Q04828 323 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CUL4AQ13619 759 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR8G1Q15617 311 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MPV17LQ2QL34 196 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 LAIR2Q6ISS4 152 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
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RNU6-1290P-201ENST00000362957 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CBR4Q8N4T8 237 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NPWQ8N729 165 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 YIPF7Q8N8F6 280 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR52E1Q8NGJ3 308 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR10AC1Q8NH08 325 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR10A6Q8NH74 314 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SUN5Q8TC36 379 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OR51E1Q8TCB6 317 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CXorf40AQ8TE69 158 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 OSTF1Q92882 214 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 FAM162AQ96A26 154 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 RDH12Q96NR8 316 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 WDR54Q9H977 334 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 BFARQ9NZS9 450 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GNG12Q9UBI6 72 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 ING4Q9UNL4 249 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 SNX8Q9Y5X2 465 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 COL4A5P29400 1685 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 NRCAMQ92823 1304 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1290P-201ENST00000362957 CNTNAP1P78357 1384 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 MTUS2Q5JR59 1369 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A0A6YYD5 115 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 A0A0D9SG52 128 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 TMEM235A6NFC5 223 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1290P-201ENST00000362957 GOSR2O14653 212 aa-1.41□□□□□ -2.64
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