RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263966.7

USP13-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP13, Length 8,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-201ENST00000263966 GPR78Q96P69 363 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 RAB40CQ96S21 281 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 SORT1Q99523 831 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 CCL19Q99731 98 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 MED29Q9NX70 200 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.046e-7■■■■□ 21.5
USP13-201ENST00000263966 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 ECSCRQ19T08 205 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 OR2D2Q9H210 308 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 MLF1P58340 268 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 HCSTQ9UBK5 93 aa14.77□□□□□ -0.04
USP13-201ENST00000263966 IGSF23A1L1A6 192 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 LALBAP00709 142 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 ZNF519Q8TB69 540 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 EXTL1Q92935 676 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 U3KQ87 197 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 A0A1W2PPQ1 181 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 SULT1A1P50225 295 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 BTG2P78543 158 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 OR10D3Q8NH80 312 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 SBF1O95248 1867 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 CALCRP30988 508 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.77□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 TMPRSS11DO60235 418 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 HGDQ93099 445 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 DEDDO75618 318 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 RHBDL1O75783 438 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 SLC2A10O95528 541 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 LOXL3P58215 753 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 PPP2CBP62714 309 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 C2orf50Q96LR7 162 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 NAA60Q9H7X0 242 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 ERVFRD-1P60508 538 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 GGTLC2Q14390 218 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 STPG3Q8N7X2 389 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 C16orf97H3BN30 126 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 FAM219AQ8IW50 185 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 MOGAT1Q96PD6 335 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 SPACA5Q96QH8 159 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 PATJQ8NI35 1801 aa14.76□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 FGF17O60258 216 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 PMP22Q01453 160 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 LSAMPQ13449 338 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 TMEM215Q68D42 235 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 WFDC3Q8IUB2 231 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 TMEM129A0AVI4 362 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 H3BVH4 76 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 SULT1A2P50226 295 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 CHODLQ9H9P2 273 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 DHRS3O75911 302 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 PNPP00491 289 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 HMGN4O00479 90 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 CALHM1Q8IU99 346 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 TO15178 435 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 MELTFP08582 738 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 SHISA5Q8N114 240 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 A0A087WUJ7 227 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 FGF11Q92914 225 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.75□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 ZNF815PA8K554 130 aa14.74□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 BTG1P62324 171 aa14.74□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 CEBPEQ15744 281 aa14.74□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 ZNF429Q86V71 674 aa14.74□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.74□□□□□ -0.05
USP13-201ENST00000263966 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms