RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPAM1P38567 509 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELOBQ15370 118 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 TICAM2Q86XR7 235 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR8A1Q8NGG7 326 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2A1Q8NGT9 310 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4C6Q8NH72 309 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 ACMSDQ8TDX5 336 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIST1H2BAQ96A08 127 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLT1D1Q96MS3 346 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 OMDQ99983 421 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 VCX3BQ9H321 246 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIGUQ9H490 435 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYTL2Q9HCH5 934 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 SETD5Q9C0A6 1442 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIVA1O15304 175 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A20O43772 301 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPOPO43791 374 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEBLO76041 1014 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 SOX14O95416 240 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1QAP02745 245 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 CA3P07451 260 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 EPB41P11171 864 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNA11P29992 359 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 VHLP40337 213 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLTPP55058 493 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPAN31Q12999 210 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1orf185Q5T7R7 199 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM236Q5W0B7 351 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZYG11AQ6WRX3 759 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 DCXRQ7Z4W1 244 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC30A7Q8NEW0 376 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR5H2Q8NGV7 314 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 HAUS1Q96CS2 278 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLCC1Q96S66 551 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 RIT2Q99578 217 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 COPS8Q99627 209 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSSK6Q9BXA6 273 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 MEAF6Q9HAF1 191 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 FBXW2Q9UKT8 454 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUP50Q9UKX7 468 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 ING4Q9UNL4 249 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 CNTNAP1P78357 1384 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 TACC2O95359 2948 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 XKRY2A2RUG3 117 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLDN5O00501 218 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 INE1O15225 51 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 CASC3O15234 703 aaKnown RBP-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 RAD1O60671 282 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 DIRAS1O95057 198 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTSEP14091 401 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRSS3P35030 304 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 HSF2Q03933 536 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10K2Q6IF99 312 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 NIPAL3Q6P499 406 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM173BQ6P4H8 233 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 METTL23Q86XA0 190 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 GKN2Q86XP6 184 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC22A24Q8N4F4 322 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 GIPC3Q8TF64 312 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 CXorf40BQ96DE9 158 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNK16Q96T55 309 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 HBEGFQ99075 208 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 MICU1Q9BPX6 476 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 TXLNGYQ9BZA5 131 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM117Q9H0C3 514 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARL6Q9H0F7 186 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 STX8Q9UNK0 236 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTLL3Q9Y4R7 772 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABCC4O15439 1325 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 NAV1Q8NEY1 1877 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYO7AQ13402 2215 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 A4D1N5 150 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLDN3O15551 220 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 MLNP12872 115 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 GTF2F2P13984 249 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFNAR1P17181 557 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIF5BP33176 963 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 CASP3P42574 277 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 NME5P56597 212 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRB2P62993 217 aaKnown RBP-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAPRE2Q15555 327 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIP10Q15642 601 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBE2UQ5VVX9 321 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPSR1Q6W5P4 371 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKFN1Q8N957 763 aa-2.94□□□□□ -2.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.6 ms