RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZSR3 168 aa21.31■■□□□ 1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa21.31■■□□□ 1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BATF2Q8N1L9 274 aa21.31■■□□□ 1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HES4Q9HCC6 221 aa21.31■■□□□ 1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USE1Q9NZ43 259 aa21.31■■□□□ 1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ODF4Q2M2E3 257 aa21.28■■□□□ 1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB18Q9NP72 206 aa21.28■■□□□ 1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIR2DS4P43632 304 aa21.27■■□□□ 1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVK11-1P61568 191 aa21.27■■□□□ 1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF273Q14593 569 aa21.27■■□□□ 1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CATSPERDQ86XM0 798 aa21.27■■□□□ 1
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2T7P0C7T2 308 aa21.26■□□□□ 0.99
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EFNB2P52799 333 aa21.25■□□□□ 0.99
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EDDM3BP56851 147 aa21.22■□□□□ 0.99
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DTX3Q8N9I9 347 aa21.22■□□□□ 0.99
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.22■□□□□ 0.99
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