RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wdr20Q9D5R2 567 aa20.02■□□□□ 0.8
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cln8Q9QUK3 288 aa20.02■□□□□ 0.8
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cxcl15Q9WVL7 167 aa20.02■□□□□ 0.8
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ralgapa1Q6GYP7 2035 aa20.02■□□□□ 0.8
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1089A0A1L1SRK6 311 aa20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Birc7A2AWP0 285 aa20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrgprb2Q3KNA1 338 aa20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Esp1Q3LHH8 102 aa20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CstbQ62426 98 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vamp1Q62442 118 aa20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kyat3Q71RI9 455 aa20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 BmperQ8CJ69 685 aa20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Entpd8Q8K0L2 497 aa20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lrrc61Q8R2R5 259 aa20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ucn3Q924A4 164 aa20.02■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Susd5G3UW60 619 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Has2P70312 552 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kctd9Q80UN1 339 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 9330161L09RikQ9D253 136 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Riox1Q9JJF3 603 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SncgQ9Z0F7 123 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Clec4dQ9Z2H6 219 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mtg2A2AFK4 405 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm5849J3QPE5 117 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stc2O88452 296 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp1a2P00186 513 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf271P15620 580 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nol4lQ6DIB4 494 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kiaa0895lQ810A5 467 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wbp1lQ8BGW2 348 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmprss11gQ8BZ10 417 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 0610009B22RikQ8R3W2 140 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Asf1bQ9DAP7 202 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q9DAS2 200 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm26992S4R1A3 76 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem196V9GX04 182 aa20.01■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Col12a1Q60847 3120 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sdk2Q6V4S5 2176 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prrt1O35449 306 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 FgrP14234 517 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem231Q3U284 315 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PmelQ60696 626 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr259Q7TS20 312 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf2Q8BIQ3 427 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RhbgQ8BUX5 455 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1044Q8VGR9 314 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc24a3Q99PD7 645 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 9530002B09RikQ9EPV7 135 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RttnQ8R4Y8 2226 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fer1l4A3KGK3 1992 aa20■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MatkP41242 505 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccr1l1P51676 356 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bmp8bP55105 399 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 VwceQ3U515 929 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc22a14Q497L9 629 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 LaynQ8C351 381 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Chrdl2Q8VEA6 426 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Steap4Q923B6 470 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrps24Q9CQV5 167 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SdhdQ9CXV1 159 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrps28Q9CY16 186 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 GltpQ9JL62 209 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Klrc3Q9QXN7 221 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc37a2Q9WU81 501 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr424E9Q0Q2 315 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr173E9QAT7 321 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 H2-T10F6T1I5 379 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fbxw25F7C9P2 466 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm20878L7N244 103 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Adrb2P18762 418 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 FasP25446 327 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Camk2bP28652 542 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Upk2P38575 184 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pax9P47242 342 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Masp1P98064 704 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc2a9Q3T9X0 538 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Krt33bQ61897 404 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Svs6Q64356 99 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf574Q8BY46 900 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Las2Q8CB14 526 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf768Q8R0T2 568 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem234Q8R1E7 140 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr887Q9EQA6 309 aa19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc18b1D3Z5L6 459 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 BC051665E9Q623 330 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Klk1b26P36369 261 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dok1P97465 482 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1087Q7TR63 313 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fbxw13Q8BI57 466 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc30a6Q8BJM5 460 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tspan9Q8BJU2 239 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Calhm5Q8R100 309 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arl6ip5Q8R5J9 188 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 RabepkQ8VCH5 380 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr60Q8VGL4 311 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mob1aQ921Y0 216 aa19.98■□□□□ 0.79
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mcts2Q9CQ21 181 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41.1 ms