Protein–RNA interactions for Protein: O88452

Stc2, Stanniocalcin-2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stc2O88452 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Stc2O88452 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Stc2O88452 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Stc2O88452 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Stc2O88452 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stc2O88452 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stc2O88452 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Stc2O88452 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stc2O88452 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Stc2O88452 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Stc2O88452 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Stc2O88452 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stc2O88452 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stc2O88452 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Stc2O88452 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stc2O88452 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stc2O88452 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stc2O88452 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stc2O88452 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stc2O88452 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stc2O88452 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Stc2O88452 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stc2O88452 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Stc2O88452 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stc2O88452 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stc2O88452 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Stc2O88452 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Stc2O88452 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stc2O88452 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Stc2O88452 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stc2O88452 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stc2O88452 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stc2O88452 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stc2O88452 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stc2O88452 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stc2O88452 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stc2O88452 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Stc2O88452 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stc2O88452 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stc2O88452 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stc2O88452 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stc2O88452 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stc2O88452 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stc2O88452 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stc2O88452 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stc2O88452 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stc2O88452 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Stc2O88452 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stc2O88452 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stc2O88452 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stc2O88452 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stc2O88452 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stc2O88452 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stc2O88452 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stc2O88452 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stc2O88452 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stc2O88452 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stc2O88452 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stc2O88452 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Stc2O88452 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stc2O88452 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stc2O88452 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stc2O88452 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stc2O88452 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Stc2O88452 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stc2O88452 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stc2O88452 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stc2O88452 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Stc2O88452 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Stc2O88452 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stc2O88452 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stc2O88452 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stc2O88452 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stc2O88452 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stc2O88452 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stc2O88452 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stc2O88452 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stc2O88452 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stc2O88452 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stc2O88452 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stc2O88452 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stc2O88452 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stc2O88452 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stc2O88452 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stc2O88452 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stc2O88452 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stc2O88452 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Stc2O88452 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stc2O88452 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stc2O88452 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stc2O88452 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stc2O88452 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Stc2O88452 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stc2O88452 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stc2O88452 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stc2O88452 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stc2O88452 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Stc2O88452 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stc2O88452 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stc2O88452 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms