Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm5849J3QPE5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm5849J3QPE5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm5849J3QPE5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm5849J3QPE5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm5849J3QPE5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm5849J3QPE5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5849J3QPE5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gm5849J3QPE5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5849J3QPE5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5849J3QPE5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5849J3QPE5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5849J3QPE5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5849J3QPE5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5849J3QPE5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm5849J3QPE5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm5849J3QPE5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm5849J3QPE5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5849J3QPE5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5849J3QPE5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm5849J3QPE5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5849J3QPE5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5849J3QPE5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5849J3QPE5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5849J3QPE5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm5849J3QPE5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5849J3QPE5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5849J3QPE5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm5849J3QPE5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5849J3QPE5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5849J3QPE5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5849J3QPE5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5849J3QPE5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5849J3QPE5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5849J3QPE5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5849J3QPE5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm5849J3QPE5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5849J3QPE5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5849J3QPE5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5849J3QPE5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5849J3QPE5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5849J3QPE5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5849J3QPE5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5849J3QPE5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5849J3QPE5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5849J3QPE5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5849J3QPE5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5849J3QPE5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm5849J3QPE5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm5849J3QPE5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm5849J3QPE5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm5849J3QPE5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5849J3QPE5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm5849J3QPE5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm5849J3QPE5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5849J3QPE5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5849J3QPE5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5849J3QPE5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5849J3QPE5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5849J3QPE5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5849J3QPE5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5849J3QPE5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5849J3QPE5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5849J3QPE5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5849J3QPE5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5849J3QPE5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5849J3QPE5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5849J3QPE5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5849J3QPE5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5849J3QPE5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5849J3QPE5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5849J3QPE5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5849J3QPE5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5849J3QPE5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5849J3QPE5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5849J3QPE5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5849J3QPE5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5849J3QPE5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5849J3QPE5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5849J3QPE5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5849J3QPE5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5849J3QPE5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5849J3QPE5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5849J3QPE5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5849J3QPE5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5849J3QPE5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5849J3QPE5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5849J3QPE5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5849J3QPE5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5849J3QPE5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5849J3QPE5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5849J3QPE5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5849J3QPE5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5849J3QPE5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5849J3QPE5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5849J3QPE5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5849J3QPE5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5849J3QPE5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5849J3QPE5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5849J3QPE5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms