RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636351.1

CLN3-247, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,292 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-247ENST00000636351 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 GHSRQ92847 366 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 BORCS8Q96FH0 119 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 TENM1Q9UKZ4 2725 aa14.89□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 J3QT63 122 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 AKR7A2O43488 359 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 PLATP00750 562 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 MSMBP08118 114 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ATF1P18846 271 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 CELP19835 753 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 PRKACBP22694 351 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 FUT6P51993 359 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 FAM76BQ5HYJ3 339 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 UTS2BQ765I0 119 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 AQP3Q92482 292 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 OR5M11Q96RB7 305 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 TMEM165Q9HC07 324 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 NEK6Q9HC98 313 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa14.88□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 A0A0A6YYJ9 748 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 RHBDL1O75783 438 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 HSMCR30P0CW71 290 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 MAP2K4P45985 399 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 GABARAPL2P60520 117 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 BDH1Q02338 343 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 IRF3Q14653 427 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 MICBQ29980 383 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 OR51F2Q8NH61 342 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 SPSB1Q96BD6 273 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 OPALINQ96PE5 141 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 MIOXQ9UGB7 285 aa14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 SRRM5B3KS81 715 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 SYNGR1O43759 233 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 FSTL3O95633 263 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 LHBP01229 141 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 GYPAP02724 150 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 HCKP08631 526 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 GLRA1P23415 457 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 CFHR2P36980 270 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 POU3F4P49335 361 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 RBP2P50120 134 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ATP1B3P54709 279 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 MTCP1P56278 107 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 DOC2BQ14184 412 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ESCO2Q56NI9 601 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 BATF2Q8N1L9 274 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 UFD1Q92890 307 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 TMEM106AQ96A25 262 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 OR8B2Q96RD0 313 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.86□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ADAM20O43506 726 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 PLPP2O43688 288 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 SULT1B1O43704 296 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 PPP3R1P63098 170 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ACTG1P63261 375 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 LCN2P80188 198 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 SCGB2A2Q13296 93 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 TEX36Q5VZQ5 186 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 SVOPQ8N4V2 548 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 RFT1Q96AA3 541 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 SEH1LQ96EE3 360 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 ZNF488Q96MN9 340 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 SPACA5Q96QH8 159 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.85□□□□□ -0.03
CLN3-247ENST00000636351 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.9 ms