RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACTA2	P62736	377 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACTG2	P63267	376 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACTC1	P68032	377 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACTA1	P68133	377 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPIB	Q01892	262 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRDX4	Q13162	271 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	HAGH	Q16775	308 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR10A6	Q8NH74	314 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPSB4	Q96A44	273 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZFP57	Q9NU63	452 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR6C68	A6NDL8	312 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	AHCYL1	O43865	530 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF728	P0DKX0	622 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRDX2	P32119	198 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNAL	P38405	381 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPM6A	P51674	278 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLURP1	P55000	103 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIR2DS1	Q14954	304 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	LCN8	Q6JVE9	175 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC80	Q76M96	950 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR4K13	Q8NH42	304 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	STMN2	Q93045	179 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	REEP6	Q96HR9	211 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	RNF170	Q96K19	258 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR8B4	Q96RC9	309 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	EBF4	Q9BQW3	602 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CENPM	Q9NSP4	180 aa		6.69	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERPINE3	A8MV23	424 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DYNC1I1	O14576	645 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	BRI3	O95415	125 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	HLA-DQA2	P01906	255 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	MZT1	Q08AG7	82 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ST3GAL3	Q11203	375 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	FHL3	Q13643	280 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	AGK	Q53H12	422 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DRAM2	Q6UX65	266 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM57B	Q71RH2	274 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR11H1	Q8NG94	326 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PIGC	Q92535	297 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCUN1D4	Q92564	292 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPTSSA	Q969W0	71 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR5B12	Q96R08	314 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CGREF1	Q99674	301 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	MICU1	Q9BPX6	476 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PPCS	Q9HAB8	311 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNB4	Q9HAV0	340 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	LRP12	Q9Y561	859 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	HERC1	Q15751	4861 aa		6.68	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	PKHD1	P08F94	4074 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TIPRL	O75663	272 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	NDUFB2	O95178	105 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TXNDC12	O95881	172 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	TK1	P04183	234 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CNTFR	P26992	372 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNB1	P62873	340 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	HNF4G	Q14541	408 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNAPC1	Q16533	368 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	CEP78	Q5JTW2	689 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		6.67	□□□□□ -1.34
NIF3L1-206	ENST00000416651	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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