RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590301.1

NPC1-208, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 2

Gene NPC1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-208	ENST00000590301	CHIA	Q9BZP6	476 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OR51I2	Q9H344	312 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	KRT84	Q9NSB2	600 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	C1RL	Q9NZP8	487 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	NLK	Q9UBE8	527 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		A0A0U1RQK1	487 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1W2PPH5	198 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	CCDC182	A6NF36	153 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OR2AT4	A6NND4	320 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		G3V2T6	193 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	DLGAP1	O14490	977 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	AKR7A2	O43488	359 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	GPR137B	O60478	399 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	FCN3	O75636	299 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	DHRS3	O75911	302 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	HTR3B	O95264	441 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SCGB1D2	O95969	90 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	IGLV3-1	P01715	115 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	FCGR1A	P12314	374 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	AMY2B	P19961	511 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	GLRA1	P23415	457 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	IER3	P46695	156 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	GPM6A	P51674	278 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	UBE2E1	P51965	193 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	EGR3	Q06889	387 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ATP6AP1	Q15904	470 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	TREML4	Q6UXN2	200 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	COMMD2	Q86X83	199 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF573	Q86YE8	665 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OR5R1	Q8NH85	324 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	AQP3	Q92482	292 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SDSL	Q96GA7	329 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	GAFA1	Q96PS6	74 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	GPR84	Q9NQS5	396 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	CLN6	Q9NWW5	311 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		6.25	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	hCG_1809904	A0A1W2PP81	198 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1W2PPE2	198 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1W2PQ09	198 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1W2PR64	198 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1W2PRV1	198 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZAR1L	A6NP61	321 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF732	B4DXR9	585 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		J3QT63	122 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		M0QZ24	198 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SLC1A7	O00341	560 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	NPFF	O15130	113 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	PRKY	O43930	277 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ATP5H	O75947	161 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	PAH	P00439	452 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	NRAS	P01111	189 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	IGHV4-59	P01825	116 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	NDUFB7	P17568	137 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OMG	P23515	440 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	FAS	P25445	335 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	DAP	P51397	102 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	EFNB1	P98172	346 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	TMED1	Q13445	227 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	DGUOK	Q16854	277 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	MIDN	Q504T8	468 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		6.24	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		6.24	□□□□□ -1.41

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