RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR5B21A6NL26 309 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 E9PI62 339 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 F5H5P2 479 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 H0YL77 283 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TSPAN9O75954 239 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ALX3O95076 343 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 LALBAP00709 142 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 IFNA2P01563 188 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 HLA-DPB1P04440 258 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PRDX4Q13162 271 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 GPR50Q13585 617 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 SPHARQ15513 63 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 XAF1Q6GPH4 301 aa8.34□□□□□ -1.07
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GGA3-209ENST00000580646 UTS2BQ765I0 119 aa8.34□□□□□ -1.07
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GGA3-209ENST00000580646 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR8S1Q8NH09 359 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 THRSPQ92748 146 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 HPS1Q92902 700 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 YIPF5Q969M3 257 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CEP19Q96LK0 163 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 MICU1Q9BPX6 476 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 BEX2Q9BXY8 128 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 CHST5Q9GZS9 411 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.34□□□□□ -1.07
GGA3-209ENST00000580646 FAM172BPA6NC97 362 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 ZNF850A8MQ14 1090 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 CLDN25C9JDP6 229 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 SERPINA3P01011 423 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 NRASP01111 189 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 TGFAP01135 160 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 MT-ND2P03891 347 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 TFAP2AP05549 437 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 FAM157CP0CG43 387 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 FAHP16930 419 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 CFHR2P36980 270 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 GNG3P63215 75 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 ATRQ13535 2644 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 ODF4Q2M2E3 257 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 TRIM16LQ309B1 348 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 YIF1BQ5BJH7 314 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.082e-6■■■□□ 14.7
GGA3-209ENST00000580646 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 SVOPQ8N4V2 548 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 GPR148Q8TDV2 347 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 PIGCQ92535 297 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 SGCDQ92629 289 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.33□□□□□ -1.08
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GGA3-209ENST00000580646 TMEM106BQ9NUM4 274 aa8.33□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 LRRC30A6NM36 301 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 CD2P06729 351 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 CTRB1P17538 263 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 CPT2P23786 658 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 IL2RGP31785 369 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 GNG2P59768 71 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 ZNF154Q13106 437 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 MED22Q15528 200 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 SPRNQ5BIV9 151 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 RDH10Q8IZV5 341 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.32□□□□□ -1.08
GGA3-209ENST00000580646 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.32□□□□□ -1.08
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