RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362		J3QT63	122 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	WNT9B	O14905	357 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	NDUFA2	O43678	99 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	LMX1B	O60663	402 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	LY6G6D	O95868	133 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	LHB	P01229	141 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	MT-ND2	P03891	347 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	LMO4	P61968	165 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	MED22	Q15528	200 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	UBE2V2	Q15819	145 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	GHSR	Q92847	366 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	MIOX	Q9UGB7	285 aa		18.84	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	ZAN	Q9Y493	2812 aa		18.83	■□□□□ 0.61
PUF60-222	ENST00000533362	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	PLPP2	O43688	288 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ATF1	P18846	271 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	HAAO	P46952	286 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	RBP2	P50120	134 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ATP1B3	P54709	279 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MICB	Q29980	383 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	AQP3	Q92482	292 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	SMR3A	Q99954	134 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	PKIB	Q9C010	78 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM165	Q9HC07	324 aa		18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	SRRM5	B3KS81	715 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ALX3	O95076	343 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	CEL	P19835	753 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	PCMT1	P22061	227 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	IL2RG	P31785	369 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	CD80	P33681	288 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	FAM166A	Q6J272	317 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	SVOP	Q8N4V2	548 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	OR51F2	Q8NH61	342 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	SGCD	Q92629	289 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		18.82	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	SULT1B1	O43704	296 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF205	O95201	554 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	GPR50	Q13585	617 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362		Q499Y3	187 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	UFD1	Q92890	307 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM106A	Q96A25	262 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	OPALIN	Q96PE5	141 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	RASL12	Q9NYN1	266 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	CKLF	Q9UBR5	152 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		18.81	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ABCA1	O95477	2261 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	C3orf80	F5H4A9	247 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MAGEB3	O15480	346 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	CYB5A	P00167	134 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MSMB	P08118	114 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	RAB3A	P20336	220 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MPZ	P25189	248 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	SOX2	P48431	317 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MTCP1	P56278	107 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	PPP3R1	P63098	170 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	IL24	Q13007	206 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	ESCO2	Q56NI9	601 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	FAM201A	Q5SY85	155 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		18.8	■□□□□ 0.6
PUF60-222	ENST00000533362	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		18.8	■□□□□ 0.6

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