RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAG2P55895 527 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM50BP56557 158 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FBXW4P57775 412 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ID2Q02363 134 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZP4Q12836 540 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TPBGQ13641 420 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NRF1Q16656 503 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFX4Q33E94 735 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNAI3Q3KNW1 292 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NCMAPQ5T1S8 102 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PAQR6Q6TCH4 344 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ENPP6Q6UWR7 440 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STAC2Q6ZMT1 411 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAVSQ7Z434 540 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMED4Q7Z7H5 227 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LYG2Q86SG7 212 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THAP8Q8NA92 274 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PXT1Q8NFP0 134 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR52I1Q8NGK6 324 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR4Q3Q8NH05 313 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR5AK3PQ8NH89 298 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR151Q8TDV0 419 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF721Q8TF20 911 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RASSF5Q8WWW0 418 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UCN3Q969E3 161 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APH1AQ96BI3 265 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UPRTQ96BW1 309 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 R3HDM4Q96D70 268 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIMD4Q96H15 378 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TXNDC15Q96J42 360 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF778Q96MU6 729 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOPNLQ96NB1 174 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERGIC2Q96RQ1 377 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRR25Q96S07 402 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF347Q96SE7 839 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VAT1Q99536 393 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACTR6Q9GZN1 396 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXD1Q9GZZ0 328 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NMRAL1Q9HBL8 299 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAR1BQ9Y6B6 198 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A1B0GV72 72 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSMB11A5LHX3 300 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC22A20A6NK97 555 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDC7O00311 574 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DCTN6O00399 190 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP1R2P9O14990 202 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC31A2O15432 143 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAMP3O60896 148 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUPT3HO75486 399 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCNKO75909 580 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFNA16P05015 189 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMIM18P0DKX4 95 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GFAPP14136 432 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EPHA2P29317 976 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDKN2BP42772 138 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CX3CR1P49238 355 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF84P51523 738 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DSCR9P59020 149 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HILS1P60008 231 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BSPH1Q075Z2 132 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ST3GAL3Q11203 375 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DLG1Q12959 904 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLA2G7Q13093 441 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPIN3Q5JUX0 258 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM45BPQ6NSW5 357 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF544Q6NX49 715 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C5orf46Q6UWT4 87 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DRAM2Q6UX65 266 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C4orf22Q6V702 233 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC37A3Q8NCC5 494 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MORN4Q8NDC4 146 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR14A16Q8NHC5 309 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RDH11Q8TC12 318 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NT5CQ8TCD5 201 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCTD4Q8WVF5 259 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms