RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590301.1

NPC1-208, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 2

Gene NPC1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-208	ENST00000590301	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	ST8SIA4	Q92187	359 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	DYRK2	Q92630	601 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	MNT	Q99583	582 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	CCL13	Q99616	98 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	PKP2	Q99959	881 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	MRO	Q9BYG7	248 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	POMP	Q9Y244	141 aa		6.28	□□□□□ -1.4
NPC1-208	ENST00000590301	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SIGLEC5	O15389	551 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	MELTF	P08582	738 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	FBP1	P09467	338 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ACKR3	P25106	362 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	RASSF2	P50749	326 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	CRISP1	P54107	249 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	RAG2	P55895	527 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	CAV3	P56539	151 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ACTR3	P61158	418 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ARF6	P62330	175 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	GNG3	P63215	75 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	APOF	Q13790	326 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SNAPC1	Q16533	368 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	C4orf46	Q504U0	113 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	LHX4	Q969G2	390 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	RNF170	Q96K19	258 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	TEAD3	Q99594	435 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	FAM206A	Q9NX38	181 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	RASL12	Q9NYN1	266 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	LRP12	Q9Y561	859 aa		6.27	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	BTBD17	A6NE02	478 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		J3QL48	77 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301		M0R1W7	72 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ST8SIA5	O15466	376 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	GSC2	O15499	205 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	KNG1	P01042	644 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	PRKACG	P22612	351 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ACSM1	Q08AH1	577 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	BNIP1	Q12981	228 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	IKZF1	Q13422	519 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	BLMH	Q13867	455 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	GID4	Q8IVV7	300 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	PIGC	Q92535	297 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	LYZL4	Q96KX0	146 aa		6.26	□□□□□ -1.41
NPC1-208	ENST00000590301	OR8B4	Q96RC9	309 aa		6.26	□□□□□ -1.41

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