RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550047.5

SLC8B1-210, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC8B1, Length 2,493 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-210ENST00000550047 ERGIC1Q969X5 290 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 PCDH15Q96QU1 1955 aa14.98□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 HPNP05981 417 aa14.97□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 UCP2P55851 309 aa14.97□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 LCN10Q6JVE6 187 aa14.97□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.97□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.97□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.97□□□□□ -0.01
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SLC8B1-210ENST00000550047 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 STARD6P59095 220 aa14.97□□□□□ -0.01
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SLC8B1-210ENST00000550047 KLHL13Q9P2N7 655 aa14.97□□□□□ -0.01
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SLC8B1-210ENST00000550047 ARG1P05089 322 aa14.96□□□□□ -0.01
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SLC8B1-210ENST00000550047 ACER2Q5QJU3 275 aa14.96□□□□□ -0.01
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SLC8B1-210ENST00000550047 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
SLC8B1-210ENST00000550047 ARV1Q9H2C2 271 aa14.96□□□□□ -0.01
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SLC8B1-210ENST00000550047 AP4M1O00189 453 aa14.95□□□□□ -0.02
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SLC8B1-210ENST00000550047 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.95□□□□□ -0.02
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SLC8B1-210ENST00000550047 SULF2Q8IWU5 870 aa14.95□□□□□ -0.02
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SLC8B1-210ENST00000550047 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 MALSU1Q96EH3 234 aa14.95□□□□□ -0.02
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SLC8B1-210ENST00000550047 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.94□□□□□ -0.02
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SLC8B1-210ENST00000550047 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 SHDQ96IW2 340 aa14.94□□□□□ -0.02
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SLC8B1-210ENST00000550047 LIPT2A6NK58 231 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 SERPINE3A8MV23 424 aa14.94□□□□□ -0.02
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SLC8B1-210ENST00000550047 LINC01565O15544 149 aa14.94□□□□□ -0.02
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SLC8B1-210ENST00000550047 DOK3Q7L591 496 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 GPR27Q9NS67 375 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 C10orf142B7Z368 130 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 RER1O15258 196 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 SERPINA2P20848 420 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 ECI1P42126 302 aa14.93□□□□□ -0.02
SLC8B1-210ENST00000550047 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
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