RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495748.5

PTPRK-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 746 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-214ENST00000495748 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 LINC01006Q8NI28 216 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 REEP6Q96HR9 211 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 DDOQ99489 341 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 C16orf95Q9H693 158 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 REEP1Q9H902 201 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 TGP01266 2768 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 A0A0U1RQK1 487 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 DHRS12A0PJE2 317 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 CDIPTO14735 213 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 TSPAN9O75954 239 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 GASTP01350 101 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 IGHV4-59P01825 116 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 SPI1P17947 270 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 POU1F1P28069 291 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 TGM4P49221 684 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 FAM3AP98173 230 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ACSM1Q08AH1 577 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 CRMP1Q14194 572 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 WDR38Q5JTN6 314 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 WDR82Q6UXN9 313 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 FAM57BQ71RH2 274 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ZNF511Q8NB15 262 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.391e-6■■□□□ 12.4
PTPRK-214ENST00000495748 SGK3Q96BR1 496 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 PGAM5Q96HS1 289 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 INTS14Q96SY0 518 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 CCL13Q99616 98 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 TEX12Q9BXU0 123 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 MUC13Q9H3R2 512 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 NIPAL2Q9H841 368 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 RAB18Q9NP72 206 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 CMC2Q9NRP2 79 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 A0A1W2PPH5 198 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 A0A1W2PQ09 198 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 C5orf63A6NC05 138 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 M0R1W7 72 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 NPFFO15130 113 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 SNX3O60493 162 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 DCTN3O75935 186 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 GLCEO94923 617 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 HMGN1P05114 100 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 GYPBP06028 91 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 H2BFMP0C1H6 154 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 GSTT1P30711 240 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 MAGEA2P43356 314 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 GSK3AP49840 483 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 UBE2E1P51965 193 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 CAV3P56539 151 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 PROK1P58294 105 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 POU4F2Q12837 409 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 IKZF1Q13422 519 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 MICAQ29983 383 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 Q6ZSV7 163 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-214ENST00000495748 Q6ZTK2 550 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms