RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284551.10

TRIM11-201, Transcript of tripartite motif containing 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM11, Length 2,715 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11-201ENST00000284551 FAM186AA6NE01 2351 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 NDUFA2O43678 99 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 ADAP1O75689 374 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 COX6A1P12074 109 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 RPA2P15927 270 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 GPR85P60893 370 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 MPPED2Q15777 294 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 PTX4Q96A99 478 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 RAB3CQ96E17 227 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 CCDC157Q569K6 752 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 A0A0J9YW62 118 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 STMND1H3BQB6 276 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 SERPINA2P20848 420 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 GMFBP60983 142 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 PMS2CLQ68D20 193 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 RAB12Q6IQ22 244 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 TMEM230Q96A57 120 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 PGAM5Q96HS1 289 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 PRRT1Q99946 306 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 MBD2Q9UBB5 411 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 A0A0A6YYH2 397 aa14.58□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 A6NJ64 397 aa14.58□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.58□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.58□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.58□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.58□□□□□ -0.07
TRIM11-201ENST00000284551 DOCK7Q96N67 2140 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 IFNA6P05013 189 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 CSNK1A1P48729 337 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 STARP49675 285 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 H3F3AP84243 136 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 HGFACQ04756 655 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 NABP1Q96AH0 204 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 FBXO17Q96EF6 278 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 CD8AP01732 235 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 SERPINF1P36955 418 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 MEF2DQ14814 521 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 KISS1Q15726 138 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 ELP2Q6IA86 826 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 BATF2Q8N1L9 274 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 LDAHQ9H6V9 325 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 SLC2A8Q9NY64 477 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 C5orf51A6NDU8 294 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 C4BPBP20851 252 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 DLSTP36957 453 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 MITD1Q8WV92 249 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 HPF1Q9NWY4 346 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 A8MXK9 166 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 D6RAR5 112 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 MSTNO14793 375 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 ANGPTL7O43827 346 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 ARFRP1Q13795 201 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 BRICD5Q6PL45 260 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 TMEM156Q8N614 296 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 IL2RAP01589 272 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 LIFP15018 202 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 SLC35A1P78382 337 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 BVESQ8NE79 360 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 H0YIZ8 118 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM11-201ENST00000284551 HPP00738 406 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms