RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 PAG1Q9NWQ8 432 aa37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF804BA4D1E1 1349 aa37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB22O15209 634 aa37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 POLD1P28340 1107 aa37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 CAVIN4Q5BKX8 364 aa37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 PODXL2Q9NZ53 605 aa37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa37.63■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK2Q92608 1830 aa37.62■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAP23O00161 211 aa37.62■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 PHKA1P46020 1223 aa37.62■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 KBTBD3Q8NAB2 608 aa37.62■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 FSD1Q9BTV5 496 aa37.62■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 RUFY2Q8WXA3 655 aa37.61■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 CNKSR1Q969H4 720 aa37.61■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 SLX4Q8IY92 1834 aa37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 REC8O95072 547 aa37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP2B4P23634 1241 aa37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MCAMP43121 646 aa37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB7AO95365 584 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLIM4O00461 696 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP37.57■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA3EO15041 775 aa37.56■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 BCAMP50895 628 aa37.56■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SCARF1Q14162 830 aa37.56■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO33Q7Z6M2 555 aa37.56■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 GPSM2P81274 684 aa37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS37DQ86XT2 251 aa37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 GGA1Q9UJY5 639 aa37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RAD50Q92878 1312 aa37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 IRS2Q9Y4H2 1338 aa37.55■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa37.54■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ZAP70P43403 619 aa37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATA5Q8NB90 893 aa37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 HMG20BQ9P0W2 317 aa37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SGSM2O43147 1006 aa37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 GYG1P46976 350 aa37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RASGRF1Q13972 1273 aa37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D32Q96NH3 1257 aa37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRKQ9NRH2 765 aa37.51■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 UFL1O94874 794 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNA5P30532 468 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TGFB2P61812 414 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 DENND2AQ9ULE3 1009 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 C22orf23Q9BZE7 217 aa37.49■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MED23Q9ULK4 1368 aa37.49■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 SGIP1Q9BQI5 828 aa37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP37.48■■■■□ 3.592e-6■■□□□ 12.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ANTXR1Q9H6X2 564 aa37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIPAP1Q4V328 841 aa37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF804AQ7Z570 1209 aa37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MPNDQ8N594 471 aa37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D16Q8TBP0 767 aa37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PI16Q6UXB8 463 aa37.46■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 DUOX1Q9NRD9 1551 aa37.46■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM25P49756 843 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 USP26Q9BXU7 913 aa37.45■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 KLRK1P26718 216 aa37.45■■■■□ 3.59
CAPNS1-206ENST00000588815 HELLSQ9NRZ9 838 aa37.44■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 POLLQ9UGP5 575 aa37.44■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ILDR2Q71H61 639 aa37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TTLL6Q8N841 843 aa37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 IGSF3O75054 1194 aa37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 TXNRD3Q86VQ6 643 aa37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 C6orf229H3BNL8 230 aa37.41■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM227BQ96M60 508 aa37.41■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 CD2APQ9Y5K6 639 aa37.41■■■■□ 3.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
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