RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582486.5

GGA3-213, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene GGA3, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-213	ENST00000582486	SLC27A2	O14975	620 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	NPHP1	O15259	732 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	CPA1	P15085	419 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	GYS1	P13807	737 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	TTC14	Q96N46	770 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	MAST3	O60307	1309 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	APBA3	O96018	575 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	BCAM	P50895	628 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		13.42	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486		M0R2C6	588 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	PLSCR1	O15162	318 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	TM4SF1	P30408	202 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	AK2	P54819	239 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	RUFY3	Q7L099	469 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	KCNA4	P22459	653 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26	2e-7	■■■■□ 24.6
GGA3-213	ENST00000582486	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
GGA3-213	ENST00000582486	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	CYP21A2	P08686	494 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	PSMA5	P28066	241 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	CUL4A	Q13619	759 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	APPBP2	Q92624	585 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	ADD2	P35612	726 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	SERPINB2	P05120	415 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	GYG1	P46976	350 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		13.38	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	MYH7	P12883	1935 aa		13.37	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486		A0A0G2JLW4	131 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	GPAA1	O43292	621 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	PDE6A	P16499	860 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	KRT32	Q14532	448 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	AKT1S1	Q96B36	256 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	FOXP2	O15409	715 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	RPS6KB1	P23443	525 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	ST5	P78524	1137 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	DDR1	Q08345	913 aa		13.36	□□□□□ -0.27
GGA3-213	ENST00000582486	PKP1	Q13835	747 aa		13.36	□□□□□ -0.27

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