RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.5■■□□□ 1.03
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CNTNAP1P78357 1384 aa21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GUL6 1792 aa21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMP14P50281 582 aa21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.47■■□□□ 1.03
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.46■■□□□ 1.03
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.45■■□□□ 1.02
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP17L8P0C7I0 530 aa21.44■■□□□ 1.02
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 DACT2Q5SW24 774 aa21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.43■■□□□ 1.02
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CCNDBP1-211ENST00000567434 KLRK1P26718 216 aa21.43■■□□□ 1.02
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CD209Q9NNX6 404 aa21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 VEGFBP49765 207 aa21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 RASSF10A6NK89 507 aa21.41■■□□□ 1.02
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CCNDBP1-211ENST00000567434 EGFRP00533 1210 aa21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL1R1P14778 569 aa21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 OGFOD1Q8N543 542 aa21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 AIDAQ96BJ3 306 aa21.41■■□□□ 1.02
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PLIN1O60240 522 aa21.4■■□□□ 1.02
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.37■■□□□ 1.01
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CCNDBP1-211ENST00000567434 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MXD3Q9BW11 206 aa21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 CIAO1O76071 339 aa21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.33■■□□□ 1.01
CCNDBP1-211ENST00000567434 ECE1P42892 770 aa21.33■■□□□ 1.01
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