RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557947.5

TCF12-208, Transcript of transcription factor 12, human

TSL 4

Gene TCF12, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF12-208	ENST00000557947	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	ADM5	C9JUS6	153 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	SNAP23	O00161	211 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	ALDH1L1	O75891	902 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	SLFN5	Q08AF3	891 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	COA1	Q9GZY4	146 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947		E9PSI1	815 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	TNS4	Q8IZW8	715 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	ECE1	P42892	770 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	GRM1	Q13255	1194 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	KAZALD1	Q96I82	304 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	GGA3	Q9NZ52	723 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	AOC2	O75106	756 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	TAF5L	O75529	589 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	SCARF1	Q14162	830 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	SUCLG2	Q96I99	432 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TCF12-208	ENST00000557947	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	UTY	O14607	1347 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	LBX1	P52954	281 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	MAP2K2	P36507	400 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	KCNJ4	P48050	445 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	HUNK	P57058	714 aa		27.6	■■■□□ 2.01
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TCF12-208	ENST00000557947	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	SULF1	Q8IWU6	871 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
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TCF12-208	ENST00000557947	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	CDCA5	Q96FF9	252 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	PTPRC	P08575	1304 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	CCER2	I3L3R5	266 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	GTF2I	P78347	998 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	ZIC5	Q96T25	663 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TCF12-208	ENST00000557947	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.58	■■■□□ 2.01
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TCF12-208	ENST00000557947	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		27.55	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
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TCF12-208	ENST00000557947	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		27.54	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	OGFOD1	Q8N543	542 aa		27.54	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	RGMB	Q6NW40	437 aa		27.53	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	USP44	Q9H0E7	712 aa		27.53	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	CAPN15	O75808	1086 aa		27.52	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	SASH1	O94885	1247 aa		27.52	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.52	■■■□□ 2
TCF12-208	ENST00000557947	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	NOG	Q13253	232 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	TSKS	Q9UJT2	592 aa		27.51	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	MMP14	P50281	582 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		27.5	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		27.49	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.48	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.48	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	MOB2	Q70IA6	237 aa		27.48	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.48	■■□□□ 1.99
TCF12-208	ENST00000557947	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.48	■■□□□ 1.99

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