RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 FKBP1BP68106 108 aa21.81■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.81■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 MED23Q9ULK4 1368 aa21.81■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 MXD3Q9BW11 206 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.79■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.79■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 MOB2Q70IA6 237 aa21.79■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 G2E3Q7L622 706 aa21.79■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 OGFOD1Q8N543 542 aa21.79■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 MYH3P11055 1940 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 SPEF2Q9C093 1822 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 SLC4A2P04920 1241 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 DACT2Q5SW24 774 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 COA1Q9GZY4 146 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 H7C1W4 665 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-214ENST00000548849 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.77■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.76■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.76■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 WNT10BO00744 389 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 ITGA6P23229 1130 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 CCDC27Q2M243 656 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 WWC1Q8IX03 1113 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 NF2P35240 595 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 GCKRQ14397 625 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 CCDC184Q52MB2 194 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 SASH1O94885 1247 aa21.73■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.73■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 KCNJ4P48050 445 aa21.72■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 FLIIQ13045 1269 aa21.72■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.72■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.72■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 SLC34A2O95436 690 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 TBC1D8O95759 1140 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 KLRK1P26718 216 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 MMP14P50281 582 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 SOX10P56693 466 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 GTF2IP78347 998 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.71■■□□□ 1.07
CS-214ENST00000548849 CSF1RP07333 972 aa21.7■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 CASP7P55210 303 aa21.7■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 PRKG1Q13976 671 aa21.7■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 CHRNDQ07001 517 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 LINS1Q8NG48 757 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 IL16Q14005 1332 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.68■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.68■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 TM4SF4P48230 202 aa21.67■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 CD209Q9NNX6 404 aa21.67■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 SNAP23O00161 211 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 TAF5LO75529 589 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-214ENST00000548849 VAMP4O75379 141 aa21.64■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 SREBF2Q12772 1141 aa21.64■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 DLGAP5Q15398 846 aa21.64■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 GPR25O00155 361 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 F8W031 263 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 FOXO4P98177 505 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 FZD1Q9UP38 647 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 F6X3S4 739 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 CERS5Q8N5B7 392 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 CACNA1FO60840 1977 aa21.61■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CS-214ENST00000548849 SPRYD7Q5W111 196 aa21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms