RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 ATP11AP98196 1134 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 PARP10Q53GL7 1025 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 NUTM2GQ5VZR2 741 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 CAPN12Q6ZSI9 719 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 USP25Q9UHP3 1055 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 FBXL5Q9UKA1 691 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 BRPF3Q9ULD4 1205 aa3.55□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 BAG3O95817 575 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 MCF2P10911 925 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 PHEXP78562 749 aa3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 EFCAB13Q8IY85 973 aa3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 ITM2BQ9Y287 266 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGA3Q08378 1498 aa3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 ATP5DP30049 168 aa3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 A6NNZ2 444 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 RASSF9O75901 435 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM13AO94988 1023 aa3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 DNAJC3Q13217 504 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 ASZ1Q8WWH4 475 aa3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 NEUROG2Q9H2A3 272 aa3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 TLK1Q9UKI8 766 aa3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 CEP19Q96LK0 163 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 SCINQ9Y6U3 715 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGA8AA7E2F4 631 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 CAVIN2O95810 425 aa3.54□□□□□ -1.84
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JMJD1C-210ENST00000542921 LMAN1P49257 510 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 KIAA0753Q2KHM9 967 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 C16orf62Q7Z3J2 963 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 VPS52Q8N1B4 723 aa3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 B4DLN1 442 aa3.53□□□□□ -1.84
JMJD1C-210ENST00000542921 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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