RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS8P62241 208 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDIA6Q15084 440 aa13.48□□□□□ -0.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRP10Q7Z4F1 713 aa13.48□□□□□ -0.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OGFOD1Q8N543 542 aa13.48□□□□□ -0.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTPN18Q99952 460 aa13.48□□□□□ -0.25
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRO3102Q9H379 93 aa13.48□□□□□ -0.25
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTFR1Q15390 333 aa13.46□□□□□ -0.25
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP53Q96M91 514 aa13.45□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PODXL2Q9NZ53 605 aa13.45□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STAP2Q9UGK3 403 aa13.45□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NR2E3Q9Y5X4 410 aa13.45□□□□□ -0.26
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa13.44□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.44□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PODNQ7Z5L7 613 aa13.43□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DACT2Q5SW24 774 aa13.42□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.42□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.42□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELP3Q9H9T3 547 aa13.41□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.41□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.41□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF22Q14807 665 aa13.4□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP3K11Q16584 847 aa13.4□□□□□ -0.26
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.26
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa13.4□□□□□ -0.26
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SSC5DA1L4H1 1573 aa13.39□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XDHP47989 1333 aa13.39□□□□□ -0.27
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.38□□□□□ -0.27
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM43AQ8N2R8 423 aa13.38□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKX2-3Q8TAU0 364 aa13.38□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRI3BPQ8WY22 251 aa13.38□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF208Q9H0X6 261 aa13.38□□□□□ -0.27
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYO3BQ8WXR4 1341 aa13.38□□□□□ -0.27
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa13.37□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STRIP1Q5VSL9 837 aa13.37□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.37□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa13.37□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa13.37□□□□□ -0.27
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VEZTQ9HBM0 779 aa13.37□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.36□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSME4Q14997 1843 aa13.36□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EYSQ5T1H1 3165 aa13.36□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.36□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.36□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GJB1P08034 283 aa13.35□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GTF2IP78347 998 aa13.35□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa13.35□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLBD2Q8NHP8 589 aa13.35□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAET1EQ8TD07 263 aa13.35□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.35□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHPF2Q9P2E5 772 aa13.35□□□□□ -0.27
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 F8W031 263 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
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