RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, human

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSNARE1-208	ENST00000524325	RIMBP2	O15034	1052 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TSNARE1-208	ENST00000524325	BCAM	P50895	628 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TSNARE1-208	ENST00000524325	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TSNARE1-208	ENST00000524325	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TSNARE1-208	ENST00000524325	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TSNARE1-208	ENST00000524325	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TSNARE1-208	ENST00000524325	MX1	P20591	662 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TSNARE1-208	ENST00000524325	ATP2B4	P23634	1241 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TSNARE1-208	ENST00000524325	CCDC93	Q567U6	631 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TSNARE1-208	ENST00000524325	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TSNARE1-208	ENST00000524325	PHKA1	P46020	1223 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	PDE1A	P54750	535 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	SNED1	Q8TER0	1413 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	CCDC102B	Q68D86	513 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	SCARF1	Q14162	830 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	WASHC4	Q2M389	1173 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	PI16	Q6UXB8	463 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TSNARE1-208	ENST00000524325	NFKBIE	O00221	500 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	AOC3	Q16853	763 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	DOK7	Q18PE1	504 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	SNRK	Q9NRH2	765 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	RASSF7	Q02833	373 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	STAP2	Q9UGK3	403 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	SOGA3	Q5TF21	947 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	LTBP1	Q14766	1721 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	27.79	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	GPATCH3	Q96I76	525 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	PPIP5K2	O43314	1243 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	MCAM	P43121	646 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	PSMD1	Q99460	953 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	MED23	Q9ULK4	1368 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	PRELP	P51888	382 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	RASGRF1	Q13972	1273 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	ATP5J	P18859	108 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	GPR162	Q16538	588 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	EYA3	Q99504	573 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSNARE1-208	ENST00000524325	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	TTC22	Q5TAA0	569 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	ZAP70	P43403	619 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325		G3V3G9	751 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	ERC2	O15083	957 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	SPATA5	Q8NB90	893 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	HAUS7	Q99871	368 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	GOLIM4	O00461	696 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	ECE2	O60344	883 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TSNARE1-208	ENST00000524325	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.7	■■■□□ 2.03

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