RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.73□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP17L12C9JPN9 530 aa6.73□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP17L11C9JVI0 530 aa6.73□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP17L21D6R901 530 aa6.73□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP17L18D6R9N7 530 aa6.73□□□□□ -1.33
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MSC-AS1-205ENST00000519068 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.73□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP17L19D6RCP7 530 aa6.73□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP17L20D6RJB6 530 aa6.73□□□□□ -1.33
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MSC-AS1-205ENST00000519068 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.73□□□□□ -1.33
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MSC-AS1-205ENST00000519068 ITGB4P16144 1822 aa6.72□□□□□ -1.33
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MSC-AS1-205ENST00000519068 USP17L5A8MUK1 530 aa6.72□□□□□ -1.33
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MSC-AS1-205ENST00000519068 SEC24BO95487 1268 aa6.72□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGKV5-2P06315 115 aa6.72□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 SERPINB4P48594 390 aa6.72□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 EVX2Q03828 476 aa6.72□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.72□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 NR6A1Q15406 480 aa6.72□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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MSC-AS1-205ENST00000519068 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.72□□□□□ -1.33
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MSC-AS1-205ENST00000519068 LINS1Q8NG48 757 aa6.72□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 EXOC6Q8TAG9 804 aa6.72□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.72□□□□□ -1.33
MSC-AS1-205ENST00000519068 TATDN2Q93075 761 aa6.72□□□□□ -1.33
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MSC-AS1-205ENST00000519068 SUSD4Q5VX71 490 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 SYNE4Q8N205 404 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 SETDB2Q96T68 719 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 USP44Q9H0E7 712 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 PNMA3Q9UL41 463 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.71□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 C6orf229H3BNL8 230 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 H7C1W4 665 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 PIK3CDO00329 1044 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 ALDH1L1O75891 902 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 NEFLP07196 543 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 GYS1P13807 737 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTK7Q13308 1070 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 GCKRQ14397 625 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 NFIXQ14938 502 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 PACS2Q86VP3 889 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 NLRP10Q86W26 655 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 CCDC191Q8NCU4 936 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.7□□□□□ -1.34
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