RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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RNF4-218ENST00000513284 SASH1O94885 1247 aa14.65□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.65□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RNF4-218ENST00000513284 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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RNF4-218ENST00000513284 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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RNF4-218ENST00000513284 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.64□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 PTPN18Q99952 460 aa14.64□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 XDHP47989 1333 aa14.64□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 H0YGN5 161 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 ATP2B4P23634 1241 aa14.63□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 CRHR2Q13324 411 aa14.63□□□□□ -0.07
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RNF4-218ENST00000513284 WNK4Q96J92 1243 aa14.63□□□□□ -0.07
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RNF4-218ENST00000513284 OGFOD1Q8N543 542 aa14.62□□□□□ -0.07
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RNF4-218ENST00000513284 EFCC1Q9HA90 598 aa14.62□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 DLL1O00548 723 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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RNF4-218ENST00000513284 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.61□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 CEP290O15078 2479 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 PDE8AO60658 829 aa14.6□□□□□ -0.07
RNF4-218ENST00000513284 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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RNF4-218ENST00000513284 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.6□□□□□ -0.07
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RNF4-218ENST00000513284 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.59□□□□□ -0.07
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RNF4-218ENST00000513284 PRO3102Q9H379 93 aa14.56□□□□□ -0.08
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RNF4-218ENST00000513284 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.55□□□□□ -0.08
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RNF4-218ENST00000513284 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
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RNF4-218ENST00000513284 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.53□□□□□ -0.08
RNF4-218ENST00000513284 DLGAP5Q15398 846 aa14.53□□□□□ -0.08
RNF4-218ENST00000513284 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.53□□□□□ -0.08
RNF4-218ENST00000513284 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.53□□□□□ -0.08
RNF4-218ENST00000513284 NBPF11Q86T75 865 aa14.53□□□□□ -0.08
RNF4-218ENST00000513284 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.53□□□□□ -0.08
RNF4-218ENST00000513284 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.53□□□□□ -0.08
RNF4-218ENST00000513284 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.53□□□□□ -0.08
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