RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 VAMP4O75379 141 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 ITGA6P23229 1130 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 COA1Q9GZY4 146 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 MED23Q9ULK4 1368 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 ABHD8Q96I13 439 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNJ4P48050 445 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 CDCA5Q96FF9 252 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 GMLQ99445 158 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 SCN9AQ15858 1988 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF609O15014 1411 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 CSF1RP07333 972 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH3P11055 1940 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 MMP14P50281 582 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM161AQ3B820 660 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 CASP7P55210 303 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 FKBP1BP68106 108 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 DACT2Q5SW24 774 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 ZIC5Q96T25 663 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 CACNA1FO60840 1977 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 CHRNDQ07001 517 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 F6X3S4 739 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 NF2P35240 595 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 MXD3Q9BW11 206 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 GTF2IP78347 998 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 BEND3Q5T5X7 828 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 SPEF2Q9C093 1822 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 PSME4Q14997 1843 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC10A3P09131 477 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 WNT10BO00744 389 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXO4P98177 505 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 TAF5LO75529 589 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 TRPA1O75762 1119 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 DGKZQ13574 1117 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 CD209Q9NNX6 404 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
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SH3BP2-220ENST00000511663 KLRK1P26718 216 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 CSRNP1Q96S65 589 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF186Q9NXI6 227 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.39■■□□□ 1.49
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SH3BP2-220ENST00000511663 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 PLIN1O60240 522 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 ALDH1L1O75891 902 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 SASH1O94885 1247 aa24.38■■□□□ 1.49
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SH3BP2-220ENST00000511663 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 DLGAP5Q15398 846 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.36■■□□□ 1.49
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SH3BP2-220ENST00000511663 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO1BO43795 1136 aa24.35■■□□□ 1.49
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SH3BP2-220ENST00000511663 SNAP23O00161 211 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 IL1R1P14778 569 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 F8W031 263 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
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