RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502686.6

CTCFL-211, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 2,023 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-211ENST00000502686 DPEP1P16444 411 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 BCAMP50895 628 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 SCARF1Q14162 830 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 OLFM4Q6UX06 510 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 LEMD3Q9Y2U8 911 aa15.97■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 CACNA1SQ13698 1873 aa15.96■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 GYG1P46976 350 aa15.96■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 EVI5LQ96CN4 794 aa15.96■□□□□ 0.15
CTCFL-211ENST00000502686 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 SNRKQ9NRH2 765 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 UFL1O94874 794 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 ATP2B4P23634 1241 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 MCAMP43121 646 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 GGA1Q9UJY5 639 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 SLX4Q8IY92 1834 aa15.95■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 GOLIM4O00461 696 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 SEC24BO95487 1268 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 KCNA3P22001 575 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 PI16Q6UXB8 463 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 KLHL34Q8N239 644 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 PAG1Q9NWQ8 432 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 ZAP70P43403 619 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 TGFB2P61812 414 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 CAVIN4Q5BKX8 364 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 TBC1D16Q8TBP0 767 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 POLLQ9UGP5 575 aa15.94■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 AK9Q5TCS8 1911 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 LTBP1Q14766 1721 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 CHMLP26374 656 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 MPNDQ8N594 471 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 FSD1Q9BTV5 496 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 SPON1Q9HCB6 807 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.93■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 RASGRF1Q13972 1273 aa15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 CASC1Q6TDU7 716 aa15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 VPS37DQ86XT2 251 aa15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 TTLL6Q8N841 843 aa15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 C6orf229H3BNL8 230 aa15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.92■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.91■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 SPATA5Q8NB90 893 aa15.91■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.91■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 KBTBD3Q8NAB2 608 aa15.9■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 C21orf2O43822 256 aa15.9■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.9■□□□□ 0.14
CTCFL-211ENST00000502686 MED23Q9ULK4 1368 aa15.89■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 PIM2Q9P1W9 311 aa15.89■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.89■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.89■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa15.89■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.88■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.88■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 SNED1Q8TER0 1413 aa15.88■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 RFX7Q2KHR2 1363 aa15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 HIP1O00291 1037 aa15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 RIMBP2O15034 1052 aa15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 SEMA3EO15041 775 aa15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 CHGBP05060 677 aa15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 FAM227BQ96M60 508 aa15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 IL25Q9H293 177 aa15.87■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 CCDC93Q567U6 631 aa15.86■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.86■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 CD209Q9NNX6 404 aa15.86■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 A0A0D9SFI3 127 aa15.85■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CTCFL-211ENST00000502686 WASHC4Q2M389 1173 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms