RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494191.6

CROCC-211, Transcript of ciliary rootlet coiled-coil, rootletin, humanhuman

TSL 5

Gene CROCC, Length 1,996 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC-211ENST00000494191 TICAM2Q86XR7 235 aa26.06■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 NLRP3Q96P20 1036 aa26.06■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 ADRA2BP18089 450 aa26.05■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 RNF20Q5VTR2 975 aa26.04■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 NFIXQ14938 502 aa26.04■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.03■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 TTC14Q96N46 770 aa26.03■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 TXNRD1Q16881 649 aa26.02■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 MAST3O60307 1309 aa26.02■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 PROM2Q8N271 834 aa26.02■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.02■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.02■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.02■■□□□ 1.76
CROCC-211ENST00000494191 M0R2C6 588 aa26.01■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 AK2P54819 239 aa26.01■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 WASHC4Q2M389 1173 aa26.01■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 VPS53Q5VIR6 699 aa26.01■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.01■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 IL27Q8NEV9 243 aa26.01■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.01■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 OSBP2Q969R2 916 aa26■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 MYH7P12883 1935 aa26■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 PDRG1Q9NUG6 133 aa26■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 HMG20BQ9P0W2 317 aa26■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 RXRBP28702 533 aa25.99■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 BCAMP50895 628 aa25.99■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.98■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 RUFY3Q7L099 469 aa25.98■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 GYS1P13807 737 aa25.98■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 CUL4AQ13619 759 aa25.98■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 SPATA5Q8NB90 893 aa25.98■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.98■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 A0A1B0GUL6 1792 aa25.97■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 PSMA5P28066 241 aa25.97■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 RASGRF1Q13972 1273 aa25.97■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 APBA3O96018 575 aa25.96■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 CNBD1Q8NA66 436 aa25.96■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.96■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 APPBP2Q92624 585 aa25.96■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.95■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.95■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.95■■□□□ 1.75
CROCC-211ENST00000494191 CYP21A2P08686 494 aa25.95■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.95■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.95■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 TM4SF1P30408 202 aa25.94■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 ADD2P35612 726 aa25.93■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 UBE4AQ14139 1066 aa25.93■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 KRT32Q14532 448 aa25.93■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.93■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 MCM4P33991 863 aa25.92■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 GYG1P46976 350 aa25.92■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 PKP1Q13835 747 aa25.92■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.92■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 PLSCR1O15162 318 aa25.91■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.91■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.91■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 RPS6KB1P23443 525 aa25.91■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 NUCB2P80303 420 aa25.91■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.9■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 A0A0G2JLW4 131 aa25.9■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 SERPINB2P05120 415 aa25.9■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 PDE6AP16499 860 aa25.9■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 NEK1Q96PY6 1258 aa25.9■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 GPAA1O43292 621 aa25.89■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 LARGE1O95461 756 aa25.89■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 ZNF827Q17R98 1081 aa25.89■■□□□ 1.74
CROCC-211ENST00000494191 UBE3CQ15386 1083 aa25.89■■□□□ 1.73
CROCC-211ENST00000494191 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.88■■□□□ 1.73
CROCC-211ENST00000494191 FOXP2O15409 715 aa25.87■■□□□ 1.73
CROCC-211ENST00000494191 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CROCC-211ENST00000494191 MAP3K12Q12852 859 aa25.87■■□□□ 1.73
CROCC-211ENST00000494191 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.87■■□□□ 1.73
CROCC-211ENST00000494191 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms