RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 KLRK1P26718 216 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF609O15014 1411 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 SNAP23O00161 211 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 FBXW7Q969H0 707 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.08■□□□□ 0.97
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 CST9Q5W186 159 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 GMLQ99445 158 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 USP44Q9H0E7 712 aa21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 RASSF10A6NK89 507 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 PLIN1O60240 522 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 USP17L8P0C7I0 530 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 VEGFBP49765 207 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 DACT2Q5SW24 774 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 USP48Q86UV5 1035 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 MXD3Q9BW11 206 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 CD209Q9NNX6 404 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 PCNTO95613 3336 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 GTF2IP78347 998 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 GGA3Q9NZ52 723 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 SCARF1Q14162 830 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 DLK2Q6UY11 383 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF16BQ96L93 1317 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 ADM5C9JUS6 153 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 OGFOD1Q8N543 542 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE4AQ14139 1066 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC24Q50LG9 513 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 SULF1Q8IWU6 871 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 IL1R1P14778 569 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.98■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 ECE1P42892 770 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 GRM1Q13255 1194 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 METTL24Q5JXM2 366 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 CAPNS2Q96L46 248 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 MMP14P50281 582 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.96■□□□□ 0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 BCAR3O75815 825 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 GYG1P46976 350 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 WNT10BO00744 389 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 CERS5Q8N5B7 392 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 JAG2Q9Y219 1238 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 SASH1O94885 1247 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 PDE8BO95263 885 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 CDCA5Q96FF9 252 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 MEIS3Q99687 375 aa20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms