RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 VPS37DQ86XT2 251 aa26.87■■□□□ 1.89
PSPC1-204ENST00000492741 PIM2Q9P1W9 311 aa26.87■■□□□ 1.89
PSPC1-204ENST00000492741 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.87■■□□□ 1.89
PSPC1-204ENST00000492741 SOCS7O14512 581 aa26.87■■□□□ 1.89
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC102BQ68D86 513 aa26.87■■□□□ 1.89
PSPC1-204ENST00000492741 MPNDQ8N594 471 aa26.87■■□□□ 1.89
PSPC1-204ENST00000492741 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.87■■□□□ 1.89
PSPC1-204ENST00000492741 C6orf229H3BNL8 230 aa26.86■■□□□ 1.89
PSPC1-204ENST00000492741 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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PSPC1-204ENST00000492741 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.84■■□□□ 1.89
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PSPC1-204ENST00000492741 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
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PSPC1-204ENST00000492741 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.79■■□□□ 1.88
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PSPC1-204ENST00000492741 C8orf34Q49A92 452 aa26.75■■□□□ 1.87
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PSPC1-204ENST00000492741 CHMLP26374 656 aa26.68■■□□□ 1.86
PSPC1-204ENST00000492741 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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PSPC1-204ENST00000492741 DOK7Q18PE1 504 aa26.68■■□□□ 1.86
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