RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 SYT10Q6XYQ8 523 aa15.75■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 HOMER1Q86YM7 354 aa15.75■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 KCNB2Q92953 911 aa15.75■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 COL15A1P39059 1388 aa15.75■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.75■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.75■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 SLFNL1Q499Z3 407 aa15.74■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa15.74■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 DDX11Q96FC9 970 aa15.74■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 ELP1O95163 1332 aa15.74■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WZG4 1122 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 CLCN6P51797 869 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 DCAF5Q96JK2 942 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 TULP2O00295 520 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 CABP4P57796 275 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 DBNDD2Q9BQY9 259 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 FOSBP53539 338 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.73■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 TNNI3KQ59H18 835 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 RNF20Q5VTR2 975 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 PGBD1Q96JS3 809 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 MED23Q9ULK4 1368 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 NBPF26B4DH59 902 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 H3BQV1 296 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 IFFO2Q5TF58 517 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 NBPF14Q5TI25 921 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 NBPF15Q8N660 670 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 UBXN4Q92575 508 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.72■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 FAM53CQ9NYF3 392 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 CDC25BP30305 580 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 CCZ1BP86790 482 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB9Q96C00 473 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 COPRSQ9NQ92 184 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.71■□□□□ 0.11
NISCH-212ENST00000488380 LMBR1LQ6UX01 489 aa15.71■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 SLC20A2Q08357 652 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 IQCB1Q15051 598 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 KRBA2Q6ZNG9 492 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 MNS1Q8NEH6 495 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 MRC1P22897 1456 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 TAF5LO75529 589 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.7■□□□□ 0.13e-6■□□□□ 10.6
NISCH-212ENST00000488380 GLI3P10071 1580 aa15.7■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 CAVIN2O95810 425 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 CASP7P55210 303 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 TPM4P67936 248 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 CREBRFQ8IUR6 639 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 SNRKQ9NRH2 765 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 HIP1O00291 1037 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 SMC2O95347 1197 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 A1BGP04217 495 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 PLA2G4AP47712 749 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 STX1AQ16623 288 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 ZNF609O15014 1411 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 TMX1Q9H3N1 280 aa15.69■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 RPS6KB1P23443 525 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 HSPA2P54652 639 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 FAM193AP78312 1265 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 DNAI1Q9UI46 699 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 ATP5JP18859 108 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 PSMA5P28066 241 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.68■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 NRDCO43847 1150 aa15.67■□□□□ 0.1
NISCH-212ENST00000488380 KINO60870 393 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms