RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 SLC4A2P04920 1241 aa21.26■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.26■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 PODNQ7Z5L7 613 aa21.26■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 STK31Q9BXU1 1019 aa21.26■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.26■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 H7C1W4 665 aa21.25■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 KLRK1P26718 216 aa21.25■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 RGS19P49795 217 aa21.25■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 WWC1Q8IX03 1113 aa21.25■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.24■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.24■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 DACT2Q5SW24 774 aa21.24■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.24■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 SNAP23O00161 211 aa21.22■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 MED23Q9ULK4 1368 aa21.22■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 ZNF609O15014 1411 aa21.21■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 SASH1O94885 1247 aa21.21■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 ITGA6P23229 1130 aa21.21■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 GCKRQ14397 625 aa21.21■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.21■□□□□ 0.99
VARS-216ENST00000428445 WNT10BO00744 389 aa21.2■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 CASP7P55210 303 aa21.2■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 FLIIQ13045 1269 aa21.19■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 PRKG1Q13976 671 aa21.19■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 COA1Q9GZY4 146 aa21.19■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.19■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 CCDC27Q2M243 656 aa21.18■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.18■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.18■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.18■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 FZD1Q9UP38 647 aa21.18■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.18■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.18■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.18■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 CSF1RP07333 972 aa21.17■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 GTF2IP78347 998 aa21.17■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 OGFOD1Q8N543 542 aa21.17■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.17■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.17■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 TAF5LO75529 589 aa21.16■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 TBC1D8O95759 1140 aa21.16■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 SOX10P56693 466 aa21.16■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 CHRNDQ07001 517 aa21.16■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.16■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa21.16■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.15■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 F6X3S4 739 aa21.15■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 VAMP4O75379 141 aa21.15■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 FKBP1BP68106 108 aa21.15■□□□□ 0.98
VARS-216ENST00000428445 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.14■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 KCNJ4P48050 445 aa21.13■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 FOXO4P98177 505 aa21.13■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 LINS1Q8NG48 757 aa21.13■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 CD209Q9NNX6 404 aa21.13■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 JAG2Q9Y219 1238 aa21.13■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 IL16Q14005 1332 aa21.12■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.12■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 CERS5Q8N5B7 392 aa21.12■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.12■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.12■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.11■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 F8W031 263 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.11■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.11■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 MRS2Q9HD23 443 aa21.11■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.1■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 AOX1Q06278 1338 aa21.09■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 CACNA1FO60840 1977 aa21.09■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 PLIN1O60240 522 aa21.09■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.09■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 NF2P35240 595 aa21.08■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 TM4SF4P48230 202 aa21.08■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 BEND3Q5T5X7 828 aa21.08■□□□□ 0.97
VARS-216ENST00000428445 A0A1B0GUL6 1792 aa21.08■□□□□ 0.96
VARS-216ENST00000428445 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
VARS-216ENST00000428445 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.07■□□□□ 0.96
VARS-216ENST00000428445 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms