RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 SCN4AP35499 1836 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 MICALL2Q8IY33 904 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 SHTN1A0MZ66 631 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE4AQ14139 1066 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 CNTROBQ8N137 903 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 CD209Q9NNX6 404 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 METTL24Q5JXM2 366 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 SPEF2Q9C093 1822 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 EYA2O00167 538 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 GNAI2P04899 355 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXW7Q969H0 707 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE8BO95263 885 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 RLBP1P12271 317 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 HTRA3P83110 453 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 DACT2Q5SW24 774 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 GMLQ99445 158 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF2IP78347 998 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 MXD3Q9BW11 206 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP4-204ENST00000416021 IL1R1P14778 569 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO3Q9UK99 471 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L8P0C7I0 530 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 SIL1Q9H173 461 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 PASKQ96RG2 1323 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 SRGAP3O43295 1099 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 CIAO1O76071 339 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 EGFRP00533 1210 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 GYG1P46976 350 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 MTX1Q13505 466 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 COPRSQ9NQ92 184 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 PANK1Q8TE04 598 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 MS4A1P11836 297 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 SASH1O94885 1247 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 SCN9AQ15858 1988 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP4-204ENST00000416021 FGFR2P21802 821 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 VPS37DQ86XT2 251 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 OGFOD1Q8N543 542 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF609O15014 1411 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 CREBZFQ9NS37 354 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAF5O00463 557 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 LPIN2Q92539 896 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM88BA6NKF7 163 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 MMP14P50281 582 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 BCAMP50895 628 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP8B2P98198 1209 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 SCARF1Q14162 830 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 JAG2Q9Y219 1238 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP350Q5VT06 3117 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC5A1P13866 664 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 USP48Q86UV5 1035 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 CERS5Q8N5B7 392 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP4-204ENST00000416021 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
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