RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411348.1

RNU6-57P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 57, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-57P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-57P-201ENST00000411348 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 LDHBP07195 334 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 P4HBP07237 508 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTPRAP18433 802 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAPK8P45983 427 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 GRIK5Q16478 980 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 LINC00114Q6XXX2 140 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 HFE2Q6ZVN8 426 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 MAP4K3Q8IVH8 894 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 OSMRQ99650 979 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 ADAM19Q9H013 955 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 RASSF4Q9H2L5 321 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 NPHS2Q9NP85 383 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 NLRP2Q9NX02 1062 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPG7Q9UQ90 795 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A1W2PP55 124 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 NFKBIEO00221 500 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 ATP11AP98196 1134 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 USPL1Q5W0Q7 1092 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 CEP135Q66GS9 1140 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 MSL1Q68DK7 614 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 ILDR2Q71H61 639 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 FBXO33Q7Z6M2 555 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 WFDC8Q8IUA0 241 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 CCNJLQ8IV13 435 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 NUDT8Q8WV74 236 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 WNT8BQ93098 351 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 NXPE3Q969Y0 559 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPP4R2Q9NY27 417 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 CDC27P30260 824 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 GNA15P30679 374 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 CABP4P57796 275 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 RAC1P63000 192 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 PRRT3Q5FWE3 981 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM117BQ6P1L5 589 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 ANKRD24Q8TF21 1146 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 BSNDQ8WZ55 320 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRIM11Q96F44 468 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 EHD4Q9H223 541 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 LIN7BQ9HAP6 207 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 SOX13Q9UN79 622 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 H3BRJ5 948 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 ACPPP15309 386 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 ITPKAP23677 461 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 BAG6P46379 1132 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 GRM2Q14416 872 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 C8orf86Q6ZUL3 223 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 NACC1Q96RE7 527 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 TCF12Q99081 682 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 PLVAPQ9BX97 442 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 BCL2L13Q9BXK5 485 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 ABCB6Q9NP58 842 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 OSGEPQ9NPF4 335 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 LATS2Q9NRM7 1088 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 FAM8A1Q9UBU6 413 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 PPME1Q9Y570 386 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-57P-201ENST00000411348 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A096LPE4 126 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A0A0MRY4 1105 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 A0A1W2PPZ6 126 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 ELNP15502 786 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 GSTT1P30711 240 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 ARL4DP49703 201 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 PIP4K2BP78356 416 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 KCNMA1Q12791 1236 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 TRAPPC3LQ5T215 181 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 TMC4Q7Z404 712 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 IL22RA1Q8N6P7 574 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 KLHL23Q8NBE8 558 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 GLIS3Q8NEA6 775 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 BCO2Q9BYV7 579 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 LACRTQ9GZZ8 138 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-57P-201ENST00000411348 C12orf49Q9H741 205 aa3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 228.8 ms