RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 UFL1O94874 794 aa21.87■■□□□ 1.09
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SH3BP5-203ENST00000408919 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.87■■□□□ 1.09
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SH3BP5-203ENST00000408919 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.87■■□□□ 1.09
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SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.77■■□□□ 1.08
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SH3BP5-203ENST00000408919 COL4A5P29400 1685 aa21.74■■□□□ 1.07
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SH3BP5-203ENST00000408919 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
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SH3BP5-203ENST00000408919 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-203ENST00000408919 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-203ENST00000408919 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP5-203ENST00000408919 MYH7P12883 1935 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-203ENST00000408919 GOLIM4O00461 696 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP5-203ENST00000408919 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.72■■□□□ 1.07
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SH3BP5-203ENST00000408919 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.72■■□□□ 1.07
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