RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP40.98■■■■■ 4.15
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CSNK1E-204ENST00000403904 AACSQ86V21 672 aa40.97■■■■■ 4.15
CSNK1E-204ENST00000403904 SLC5A1P13866 664 aa40.96■■■■■ 4.15
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CSNK1E-204ENST00000403904 DBNDD2Q9BQY9 259 aa40.91■■■■■ 4.14
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CSNK1E-204ENST00000403904 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
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CSNK1E-204ENST00000403904 CAVIN4Q5BKX8 364 aa40.85■■■■■ 4.13
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CSNK1E-204ENST00000403904 VPS33BQ9H267 617 aa40.82■■■■■ 4.13
CSNK1E-204ENST00000403904 SBF1O95248 1867 aa40.82■■■■■ 4.12
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CSNK1E-204ENST00000403904 LARGE2Q8N3Y3 721 aa40.82■■■■■ 4.12
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF804AQ7Z570 1209 aa40.81■■■■■ 4.12
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CSNK1E-204ENST00000403904 DCAF8Q5TAQ9 597 aa40.78■■■■■ 4.12
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CSNK1E-204ENST00000403904 TTC41PQ6P2S7 1318 aa40.68■■■■■ 4.1
CSNK1E-204ENST00000403904 SCN9AQ15858 1988 aa40.67■■■■■ 4.1
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CSNK1E-204ENST00000403904 ATP5JP18859 108 aa40.66■■■■■ 4.1
CSNK1E-204ENST00000403904 AKAP11Q9UKA4 1901 aa40.66■■■■■ 4.1
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