RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
GNPTAB-202ENST00000392919 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
GNPTAB-202ENST00000392919 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
GNPTAB-202ENST00000392919 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 LMBR1LQ6UX01 489 aa34.11■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 DLK2Q6UY11 383 aa34.11■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM57Q8N5G2 664 aa34.11■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 PSME4Q14997 1843 aa34.11■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 MED23Q9ULK4 1368 aa34.11■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 RLBP1P12271 317 aa34.1■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 TXNRD3Q86VQ6 643 aa34.1■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 MPHOSPH8Q99549 860 aa34.09■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 CELF2O95319 508 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 CDC37L1Q7L3B6 337 aa34.08■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 PODNQ7Z5L7 613 aa34.08■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 USP48Q86UV5 1035 aa34.08■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 MEIS3Q99687 375 aa34.08■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa34.07■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 KLRK1P26718 216 aa34.07■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 LEMD3Q9Y2U8 911 aa34.07■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 CHMP3Q9Y3E7 222 aa34.07■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD44Q8N8A2 993 aa34.06■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 TLL2Q9Y6L7 1015 aa34.06■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 USP17L3A6NCW0 530 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 USP17L4A6NCW7 530 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 PLIN1O60240 522 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 CHRNDQ07001 517 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 USP17L1Q7RTZ2 530 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 AGBL3Q8NEM8 1001 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 GMLQ99445 158 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD2Q9GZV1 360 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF408Q9H9D4 720 aa34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF804BA4D1E1 1349 aa34.04■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF609O15014 1411 aa34.04■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 SNAP23O00161 211 aa34.03■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 CYP4F22Q6NT55 531 aa34.03■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 PANK1Q8TE04 598 aa34.03■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 MXD3Q9BW11 206 aa34.03■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 FOXN1O15353 648 aa34.02■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 CAPNS2Q96L46 248 aa34.02■■■■□ 3.04
GNPTAB-202ENST00000392919 TAF5LO75529 589 aa34.01■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 GRM1Q13255 1194 aa34.01■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT26Q7Z3Y9 468 aa34.01■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 SAPCD2Q86UD0 394 aa34.01■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 ADM5C9JUS6 153 aa34■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 GNAI3P08754 354 aa34■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 COA1Q9GZY4 146 aa34■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A1B0GUL6 1792 aa34■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC57Q2TAC2 916 aa33.99■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 DACT2Q5SW24 774 aa33.99■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 ITPRIPQ8IWB1 547 aa33.99■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 WBP1LQ9NX94 342 aa33.99■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 USP17L8P0C7I0 530 aa33.98■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 MS4A1P11836 297 aa33.98■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXW7Q969H0 707 aa33.98■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 GGA3Q9NZ52 723 aa33.98■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNJ4P48050 445 aa33.97■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 HDAC5Q9UQL6 1122 aa33.97■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 SCARF1Q14162 830 aa33.96■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 MYOZ2Q9NPC6 264 aa33.96■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 IRS2Q9Y4H2 1338 aa33.96■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 THSD7BQ9C0I4 1608 aa33.95■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
GNPTAB-202ENST00000392919 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 ECE1P42892 770 aa33.94■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 STRIP1Q5VSL9 837 aa33.94■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa33.93■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 AIDAQ96BJ3 306 aa33.93■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 AOC2O75106 756 aa33.92■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 TAF7LQ5H9L4 462 aa33.92■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 C20orf194Q5TEA3 1177 aa33.92■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 GNAI2P04899 355 aa33.91■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 TTLL5Q6EMB2 1281 aa33.91■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 TNS4Q8IZW8 715 aa33.91■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 CD209Q9NNX6 404 aa33.91■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 GTF2IP78347 998 aa33.9■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 PDE3AQ14432 1141 aa33.9■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 SULF1Q8IWU6 871 aa33.9■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 CNNM1Q9NRU3 951 aa33.9■■■■□ 3.02
GNPTAB-202ENST00000392919 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
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