RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 CBX8Q9HC52 389 aa23.43■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 A0A087WWV3 80 aa23.42■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.42■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 FBXW7Q969H0 707 aa23.42■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.42■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.42■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.41■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.41■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.41■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 FBXO3Q9UK99 471 aa23.41■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 BRINP3Q76B58 766 aa23.4■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 ATP2B3Q16720 1220 aa23.4■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.4■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.39■■□□□ 1.34
PAN3-201ENST00000380958 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.39■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 EYA2O00167 538 aa23.39■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 CYP21A2P08686 494 aa23.39■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 IL2RBP14784 551 aa23.39■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.38■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.38■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.38■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 H3BQV1 296 aa23.38■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 IFFO2Q5TF58 517 aa23.38■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 BRF1Q92994 677 aa23.37■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 PGBD1Q96JS3 809 aa23.37■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 ZNF165P49910 485 aa23.37■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.37■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 Q6ZUG5 572 aa23.37■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 ZNF592Q92610 1267 aa23.37■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 ABCA3Q99758 1704 aa23.36■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.36■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.36■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.332e-6■■□□□ 13.7
PAN3-201ENST00000380958 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.332e-9■■■□□ 15.2
PAN3-201ENST00000380958 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 GOLIM4O00461 696 aa23.34■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.34■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.34■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 PFKFB2O60825 505 aa23.34■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 A1BGP04217 495 aa23.34■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.34■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.34■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 GUCY1B3Q02153 619 aa23.33■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 ARID5BQ14865 1188 aa23.33■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 ABCC12Q96J65 1359 aa23.33■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 LAMA4Q16363 1823 aa23.33■■□□□ 1.33
PAN3-201ENST00000380958 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.32■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.32■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.32■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.32■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 A0A1B0GUL7 405 aa23.32■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 ZNF75DP51815 510 aa23.32■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 CFAP45Q9UL16 551 aa23.32■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 RESTQ13127 1097 aa23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 CCDC144BQ3MJ40 725 aa23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 TPM3P06753 285 aa23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 TIMM10P62072 90 aa23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 TCIRG1Q13488 830 aa23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 FBXL16Q8N461 479 aa23.31■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.3■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 CHST3Q7LGC8 479 aa23.3■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 TNNT1P13805 278 aa23.3■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.3■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 SCRN1Q12765 414 aa23.29■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 LRRC24Q50LG9 513 aa23.29■■□□□ 1.32
PAN3-201ENST00000380958 ATL3Q6DD88 541 aa23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms