RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 ECE1P42892 770 aa25.6■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.6■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 MIER1Q8N108 512 aa25.6■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 DACT2Q5SW24 774 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 OGFOD1Q8N543 542 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 KAZALD1Q96I82 304 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 SUCLG2Q96I99 432 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.59■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 EGFRP00533 1210 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.58■■□□□ 1.69
PITX3-201ENST00000370002 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.57■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 IFFO2Q5TF58 517 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 USP48Q86UV5 1035 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 USP44Q9H0E7 712 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 CD209Q9NNX6 404 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 UBE4AQ14139 1066 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 SULF1Q8IWU6 871 aa25.56■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 TAF5LO75529 589 aa25.55■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.55■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.55■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 IL1R1P14778 569 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 SCARF1Q14162 830 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 WBP1LQ9NX94 342 aa25.54■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 SCN9AQ15858 1988 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 KLRK1P26718 216 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 MAP2K2P36507 400 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 CAPNS2Q96L46 248 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 GGA3Q9NZ52 723 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.53■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 AIDAQ96BJ3 306 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.52■■□□□ 1.68
PITX3-201ENST00000370002 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 KIF16BQ96L93 1317 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 GTF2IP78347 998 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.5■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 SASH1O94885 1247 aa25.49■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 SNAP23O00161 211 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 FKBP1BP68106 108 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 FBXW7Q969H0 707 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 PSME4Q14997 1843 aa25.48■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 WNT10BO00744 389 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 FBXO3Q9UK99 471 aa25.47■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 ADM5C9JUS6 153 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 PLIN1O60240 522 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.46■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 HUNKP57058 714 aa25.45■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 MXD3Q9BW11 206 aa25.45■■□□□ 1.67
PITX3-201ENST00000370002 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.45■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 FOXN1O15353 648 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 PDE8BO95263 885 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 NOGQ13253 232 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 CCDC102AQ96A19 550 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 CDCA5Q96FF9 252 aa25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PITX3-201ENST00000370002 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms